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新虫 (小有名气)

[求助] 怎样做一个大分子的其中某一个原子的静电势图？已有1人参与

一个分子上有个Se原子，另一个分子上有个N原子，这两个分子通过Se--N的形成结合在一起，我想问问怎么做出Se原子一端的静电势图呢？以具体到能看到Se的静电势图为标准。

1楼 2014-03-02 20:01:57

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至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

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zhou2009: 金币+5 2014-03-02 21:17:56
xiemeng101: 金币+5, ★有帮助 2014-03-03 19:06:07

分别对两个分子作静电势图，见此贴的例子
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布
http://hi.baidu.com/sobereva/item/692f9a83d8e9a5c8b071545d
另外也可参考
使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用
http://hi.baidu.com/sobereva/item/6601fff28c4fd9d643c36acc

也很推荐绘制等值线图，对分析静电相互作用很有益，如此文所示：
静电效应主导了氢气、氮气二聚体的构型
http://hi.baidu.com/sobereva/item/fe74588e6c0223ebe496e088
作等值线图的方法是进入主功能4，作图函数选择静电势，选择contour map

2楼2014-03-02 21:14:58

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