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liwenliang

金虫 (正式写手)

[交流] 求教生物酶方面的动力学模拟计算

本人打算做生物酶方面的动力学模拟计算,但是由于是新手,且没有很多的生物基础,弱弱的问一下,在选择体系的时候有哪些注意事项,有没有什么选择体系的关键词,杂志,做体系的时候,什么着眼点比较好?不胜感谢!

[ Last edited by zzgyb on 2008-1-25 at 12:37 ]
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dongping001

木虫 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版。
首先选择软件,例如sybyl,二是选择力场,这是关键,一定要选择适合做蛋白质分子的力场,还有非键作用力设置(静电作用力、氢键),温度,时间等,先看文献看人家选的是什么软件、力场、建模等信息,再摸索,再具体的可以问问高人
2楼2008-01-25 12:15:26
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liwenliang

金虫 (正式写手)

软件就是MD但是不会选择体系,就是感觉无从下手

我现在已经购买的MD软件,也阅读了一些人的文献,可是在选择体系的时候还是很困惑,我想知道的具体些,能让我更快的入门。谢谢!
3楼2008-01-25 12:26:25
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匿名

用户注销 (小有名气)



zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版。
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4楼2008-01-31 10:43:01
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