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minbad

木虫 (正式写手)

[求助] ADMP的chk分析 已有1人参与

本人在学习Sobereva大神的“将Gaussian从头算动力学轨迹转换为pdb轨迹的程序GauMDconv”程序的时候,
在fchk文件里面

179行:
             Trajectory Num results per geometry        I               16
              ......
181行:
              Traj num       1 Results for each geomet   R   N=         816
              ......
我想知道这个16从哪儿来的,代表什么意思呢?
我知道816=16*51(50+1个轨迹)
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★
gkf高: 金币+2 2014-02-22 20:55:05
这部分信息的含义没有公开的说明,只能靠猜。如果想彻底弄明白每一项的含义,只有两个办法:1 给高斯客服写信 2 分析源代码。
实际上只要得到自己需要的数据就够了,彻底弄清楚也没必要。
5楼2014-02-22 16:51:56
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2014-02-22 09:04:32
minbad: 金币+15, ★★★很有帮助 2014-03-01 20:40:12
这部分内容不会被GauMDconv利用到。这部分记录的是轨迹每一帧对应的一些特征、状态信息,诸如这一帧对应的时间、动能、势能之类。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2014-02-21 23:42:47
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minbad

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2014-02-21 23:42:47
这部分内容不会被GauMDconv利用到。这部分记录的是轨迹每一帧对应的一些特征、状态信息,诸如这一帧对应的时间、动能、势能之类。

看了您的源代码,知道这部分不会读取,但具体是什么东西呢?推荐了说明或文献看看也可以,多谢!

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-02-22 10:12:09
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minbad

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2014-02-21 23:42:47
这部分内容不会被GauMDconv利用到。这部分记录的是轨迹每一帧对应的一些特征、状态信息,诸如这一帧对应的时间、动能、势能之类。

对比了log文件,大概知道这十六个数字的意思了。但是为什么等9~11与第12~14完全相同呢?是什么意思?

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-02-22 15:18:07
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