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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS中仿真结束，如何统计模型分子个数信息，挨个数太麻烦！
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jiafeimao236

银虫 (正式写手)

[求助] MS中仿真结束，如何统计模型分子个数信息，挨个数太麻烦！ 已有1人参与

请教各位虫友，MS中仿真结束，如何输出模型分子个数信息，挨个数太麻烦！
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1楼 2014-02-21 15:53:36
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smutao

禁虫 (著名写手)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-22 11:03:35
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4楼2014-02-21 22:17:34
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smutao

禁虫 (著名写手)
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jiafeimao236: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-02-21 22:09:55
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-22 11:03:29
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2楼2014-02-21 21:20:58
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jiafeimao236

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-02-21 21:20:58
可以输出PDB文件 然后做进一步的统计

非常感谢！由于我是新手，能再说的详细点吗？比如我想统计算完的模型中的分子数，如何做呢？？
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3楼2014-02-21 22:11:25
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jiafeimao236

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by smutao at 2014-02-21 22:17:34
这个是manual里面有的
可以参考这个
https://community.accelrys.com/message/17925

非常感谢！！您的意思是将xtd或xsd文件导出为pdb文件？
然后呢？
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5楼2014-02-21 22:51:04
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smutao

禁虫 (著名写手)
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6楼2014-02-21 23:01:34
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jiafeimao236

银虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by smutao at 2014-02-21 23:01:34
pdb文件里面是有每个分子的原子的信息的 用文本编辑器查看一下...

哦。
7楼2014-02-21 23:13:50
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jiafeimao236

银虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by smutao at 2014-02-21 23:01:34
pdb文件里面是有每个分子的原子的信息的 用文本编辑器查看一下...

我在MS中运算完的xsd文件，导出后发现分子数没变。。。实际上我模拟的化学反应，分子数应该变了啊。您知道这是怎么回事吗？
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8楼2014-02-23 15:34:19
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smutao

禁虫 (著名写手)
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9楼2014-02-23 15:35:07
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jiafeimao236

银虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by smutao at 2014-02-23 15:35:07
你确定是反应？...

是的。https://community.accelrys.com/thread/5317
这人和我有相同的问题，但是解答没看懂啊，，，，
您知道这是怎么做吗？？
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10楼2014-02-23 16:41:31
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