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geminiboy

木虫 (初入文坛)

[求助] 求助materials studio计算dpd 需要的摩尔体积和溶解度参数 已有2人参与

我参考论坛经验,blend模块计算的太不靠谱  但是大家都没有说怎么用amorphous cell 和discover模块计算摩尔体积,菜鸟不知啊 请高手指点
模块synthia可以计算polymer的 我有疑问譬如药物分子上面粗粒化的苯环或环己烷衍生结构也可以这么算?

求指点,不甚感谢
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pielang

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-20 08:23:37
今天也在头疼这件事,我现在的方法是用内聚能求出水分子或者苯分子的溶解度参数,然后摩尔体积就用实际的密度算,然后去水和苯的平均值,不过这样算出来的chi值好像大的离谱。

而且DPD模块里面默认的粒子半径和质量到底是多少啊,不能调好歹也告诉一声吧,我查了整个help文档都没有查到。。。求大神告知
5楼2014-02-19 23:02:46
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geminiboy

木虫 (初入文坛)

看过 就是没找到那边输出摩尔体积的结果  amorphous cell 和discover在material studio 7 也没看到analysis选项  初学者 请赐教啊
2楼2014-02-18 23:52:11
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geminiboy

木虫 (初入文坛)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-19 11:02:33
相似的问题就是怎么计算溶剂分子(譬如水、DMSO)的摩尔体积和溶解度参数?
3楼2014-02-19 00:10:43
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hexingyi

木虫 (职业作家)


【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流! 2014-02-20 08:23:23
溶解度参数需要晶体结构
无定型的也能计算吗?好像是高分子的才能算,AMORPHOUS只是建立模型
具体计算得用到FORCITE和discover,然后再分析,分析在forcite里面
其实溶剂的根本不用算,找本溶解度手册一查不就知道了吗?
4楼2014-02-19 22:39:27
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