应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 有smiles分子格式，如何得到相应的3D，mol2格式的化学结构式？
81/1返回列表
查看: 3932  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

虫末末

新虫 (小有名气)

[求助] 有smiles分子格式，如何得到相应的3D，mol2格式的化学结构式？ 已有1人参与

2张图，需要从smiles转化成mol2、

我这里的corina不能用。还有别的办法吗？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-02-18 19:48:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-19 11:01:21
虫末末: 金币+10, ★有帮助, 还在迷茫中 2014-02-20 14:56:58
本帖内容被屏蔽
2楼2014-02-18 19:58:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

smutao

禁虫 (著名写手)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-20 22:00:56
本帖内容被屏蔽
3楼2014-02-18 19:59:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

虫末末

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by smutao at 2014-02-18 19:59:09
babel -i in.smiles -o out.mol2

您好。这是什么意思啊？没看懂啊。

我是新手。
赞一下 回复此楼
4楼2014-02-18 20:13:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

虫末末

新虫 (小有名气)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-19 11:01:30
引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-02-18 19:58:50
babel -i in.smiles -o out.sdf

明白楼主的意思了。我试过这个办法了。可以倒出文件来。

可是用sybyl还是打不开。

只能认为文件格式没有转换成功。
赞一下 回复此楼
5楼2014-02-18 21:00:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

smutao

禁虫 (著名写手)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-20 22:02:11
本帖内容被屏蔽
6楼2014-02-20 15:08:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

虫末末

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by smutao at 2014-02-20 15:08:26
你用pymol打开先试试
...

好。我再试试
回复此楼
7楼2014-02-20 21:23:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

虫末末

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by smutao at 2014-02-20 15:08:26
你用pymol打开先试试
...

我是用软件转化无机小分子。
赞一下 回复此楼
8楼2014-02-20 21:26:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 虫末末 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 070300化学学硕求调剂 +5 太想进步了0608 2026-03-16 5/250 2026-03-16 14:11 by xwxstudy
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[文学芳草园] 伙伴们，祝我生日快乐吧 +15 myrtle 2026-03-10 24/1200 2026-03-15 21:16 by 苏州_逗号
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 297求调剂 +4 学海漂泊 2026-03-13 4/200 2026-03-14 11:51 by 热情沙漠
[考研] 306求调剂 +4 唐薏薏 2026-03-09 4/200 2026-03-14 01:19 by JourneyLucky
[考研] 271求调剂 +10 生如夏花… 2026-03-11 10/500 2026-03-14 00:35 by 卖报员小雨
[考研] 求调剂，一志愿江南大学环境工程085701 +3 Djdjj12 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:31 by JourneyLucky
[考研] 0703化学调剂 +4 快乐的香蕉 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:41 by JourneyLucky
[考研] 336求调剂 +6 Iuruoh 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:06 by JourneyLucky
[考研] 315求调剂 +9 小羊小羊_ 2026-03-11 10/500 2026-03-13 21:13 by SXNU李老师
[考研] 考研调剂 +4 芬达46 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:04 by ruiyingmiao
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 321求调剂（食品/专硕） +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
[考博] 26读博 +4 Rui135246 2026-03-12 10/500 2026-03-13 07:15 by gaobiao
[考研] 420求调剂 +4 莫向外求11 2026-03-10 6/300 2026-03-12 14:41 by ruiyingmiao
[考研] 大连大学化学专业研究生调剂 +3 琪久. 2026-03-10 8/400 2026-03-11 10:02 by 琪久.
[考研] 调剂 +5 呵唔哦豁 2026-03-10 5/250 2026-03-10 22:00 by 28375m
[考研] 一志愿：武汉理工，材料工程，英二数二 总分314 +3 2202020125 2026-03-10 4/200 2026-03-10 13:54 by xiongyaxuan
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭