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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 有同志们用过Gaussian计算过次生土壤矿物么？
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nima0332

银虫 (小有名气)

[求助] 有同志们用过Gaussian计算过次生土壤矿物么？

有小哥们用过Gaussian计算过次生土壤矿物么？小弟不胜感激~
Q1  土壤矿物如蒙脱石、伊利石怎么用chemoffice画啊，有相关文献么？
Q2   有适配AMD处理器的Gaussian资源么？或者如何将适用intel处理器的软件编译一下呢？难不难哇~
Q3   AMD处理器和intel处理器，使用gaussian该如何计算呢？
     小弟从未接触过量子化学，第一次的接触，正在学习中，大家有什么建议都会对小弟有帮助的，谢过~
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仁者不以盛衰改节，义者不以生死易心
1楼 2014-02-16 15:18:20
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-02-20 19:48:12
Q1这些矿物都是晶体？晶体用Gaussian处理实在不太行。可以试试PWscf、VASP，嫌麻烦可以试试CASTEP（如果买了）。有关晶体结构还是去ICSD查一下比较好，大部分晶体建模程序都支持导入。如果没有就只能凭借你的了解去构建。
Q2AMD的Gaussian貌似前两天有人问过,http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6954870&fpage=1最后不知道怎么解决的，你可以问问该帖的LZ。据我所知国内大陆应该买不到源码，如果正规渠道购买应该会询问计算机配置。
Q3计算的资料小木虫上面有，目前不太清楚你计算想得到什么。如果真的需要Gaussian的资料，量化版找得到不少，或者遇到问题到量化版来问。如果是采用PWscf、VASP、CASTEP这一类的，出门右转去第一原理版，也能找得到相关的资料。
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nima0332
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
2楼2014-02-16 20:06:42
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卡开发发

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Ab Initio Amateur
★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-02-25 07:15:06
引用回帖:
4楼: Originally posted by nima0332 at 2014-02-24 11:06:34
再次感谢您，上次求助AMD的那个帖子，是我小老板发的。。所以问题还木有解决。但是他貌似说有gaussian的源码，但不知打怎么编译一下才能解决。。
最i在论坛上逛逛，觉得还是挺有收获的~...

我也没编译过gaussian。我手头上只有g03的src，怎么编译我也要查一下资料，你可以先看看其他人的回复，我有消息会回帖的。
实在不行就买一个，其中一个流程就是登记cpu型号，由guassian原厂编译后发送过来。如果要发文章这是迟早要买的，或者换一台计算机。
另外，你的模型是团簇还是周期结构？如果是周期结构，那么我非常不推荐Gaussian。
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5楼2014-02-24 11:21:01
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
sob博士发过文章怎么编译g09src。http://hi.baidu.com/sobereva/item/c07958122d9ed8f8dceecad5，如果还有啥问题可以直接问她，可能可以更快更专业地解决这个问题。
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6楼2014-02-24 23:30:18
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nima0332

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-02-16 20:06:42
Q1这些矿物都是晶体？晶体用Gaussian处理实在不太行。可以试试PWscf、VASP，嫌麻烦可以试试CASTEP（如果买了）。有关晶体结构还是去ICSD查一下比较好，大部分晶体建模程序都支持导入。如果没有就只能凭借你的了解去 ...

谢谢您！！！！
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仁者不以盛衰改节，义者不以生死易心
3楼2014-02-20 17:33:32
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nima0332

银虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-02-16 20:06:42
Q1这些矿物都是晶体？晶体用Gaussian处理实在不太行。可以试试PWscf、VASP，嫌麻烦可以试试CASTEP（如果买了）。有关晶体结构还是去ICSD查一下比较好，大部分晶体建模程序都支持导入。如果没有就只能凭借你的了解去 ...

再次感谢您，上次求助AMD的那个帖子，是我小老板发的。。所以问题还木有解决。但是他貌似说有gaussian的源码，但不知打怎么编译一下才能解决。。
最i在论坛上逛逛，觉得还是挺有收获的~
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4楼2014-02-24 11:06:34
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nima0332

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-02-24 23:30:18
sob博士发过文章怎么编译g09src。http://hi.baidu.com/sobereva/item/c07958122d9ed8f8dceecad5，如果还有啥问题可以直接问她，可能可以更快更专业地解决这个问题。

谢谢！
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7楼2014-02-25 08:52:48
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nima0332

银虫 (小有名气)
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2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-02-16 20:06:42
Q1这些矿物都是晶体？晶体用Gaussian处理实在不太行。可以试试PWscf、VASP，嫌麻烦可以试试CASTEP（如果买了）。有关晶体结构还是去ICSD查一下比较好，大部分晶体建模程序都支持导入。如果没有就只能凭借你的了解去 ...

您好，前几天我把AMD处理器的电脑安装上了Gaussian。（是32核64G内存的机器，因为intel的处理器实在太贵了）。软件包就是在小木虫上找的，发现目前运行没有错误。
所以，请问“Gaussian在AMD机器上编译”是不是就是一个伪命题呢。还是说，经过编译的Gaussian，在AMD机器上运行就会更快呢（因为我发现高斯在这台机器上运行没有想象中的迅猛啊。。）
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8楼2014-03-18 20:07:28
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卡开发发

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8楼: Originally posted by nima0332 at 2014-03-18 20:07:28
您好，前几天我把AMD处理器的电脑安装上了Gaussian。（是32核64G内存的机器，因为intel的处理器实在太贵了）。软件包就是在小木虫上找的，发现目前运行没有错误。
所以，请问“Gaussian在AMD机器上编译”是不是就 ...

看你拿到的是什么样的包，g03原来有源码包，使用的时候需要先编译，安装。后来因为一些历史性的事件，Gaussian就不卖给中国大陆源码包，只卖编译好的。
如果合适的编译器，是有可能运行稍快，目前来看，Gaussian计算和有些程序比起来并不是那么快，也不再像以前那样一家独大。至于为什么不快，这个不好说，比如linux 比windows 的版本就是快，至今不知道你用的是什么样的系统。

另外，对于新手，总觉得还是直接采用Dmol3或是CASTEP比较好，要不然后面出啥问题你更折腾不起，如果没买就问人借吧。
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9楼2014-03-18 20:56:17
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nima0332

银虫 (小有名气)
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9楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-03-18 20:56:17
看你拿到的是什么样的包，g03原来有源码包，使用的时候需要先编译，安装。后来因为一些历史性的事件，Gaussian就不卖给中国大陆源码包，只卖编译好的。
如果合适的编译器，是有可能运行稍快，目前来看，Gaussian计 ...

我用的linu的centOS5
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10楼2014-03-18 21:45:21
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