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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » [求助]跑分子动力学的目的是什么？
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tpp001

金虫 (著名写手)

[交流] [求助]跑分子动力学的目的是什么？

我是新手，刚刚接触这方面，不知道对一个体系跑动力学的目的是什么？用什么样的标准来判断跑动力学的结果不错？
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迷茫在知识的海洋里，需要你的指导。thankyou
1楼 2008-01-17 14:39:49
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brover

捐助贵宾 (正式写手)

学术刺客
★
csfn(金币+1,VIP+0):3q
防止分子的结构没有达到能量最低而只是停留在“局部”能量最小。
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2楼2008-01-17 15:06:58
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cuihang

铁杆木虫 (正式写手)

VASPer
★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):3q
可以得到系统的各种性质。当然，对不对最终的判据还是实验。LS说的模拟退火法也是分子动力学的一个应用
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聪明人知道自己是傻子，傻子以为自己是聪明人
3楼2008-01-17 16:06:52
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allenym

木虫 (小有名气)
建立在一定假设上的模拟，准确与否还是要靠试验验证。
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4楼2008-02-01 15:51:37
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jun.wang

银虫 (小有名气)
★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的回答，欢迎继续关注计算模拟版！
分子动力学首先是一种构象采样的办法，和MC类似，通过对相空间较为全面的采样，可以有效估计体系配分函数，从而计算热力学量。

同时由于动力学方程相对于MC等随机算法的物理合理性，还可以用于研究物质输运、能量耗散等非平衡过程，成为考察系统动力学的微观过程的重要手段。

更宏观的来讲，正如上面同学讲到的，动力学模拟方法就是为了填充实验观测和微观理论之间的gap的一种手段，因为实验观测的现象通常都是宏观空间和时间尺度的，通过模拟来让我们了解这些宏观现象与体系微观性质之间是怎样具体联系的。
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5楼2008-02-01 17:30:51
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jinzslw

新虫 (初入文坛)
★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的回答，欢迎继续关注计算模拟版！
MD是为了在遍及整个相空间运动的一种方法，对于我们研究的（模拟的）体系而言，其运动时微观层次上，鉴于现有计算水平和理论发展的现状，这种遍及都只能是近似的。有了MD我们可以模拟计算很多的宏观性质，其统计基础要设计系综原理。MD分为平衡态和非平衡态。
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6楼2008-02-02 16:04:58
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