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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 分子模拟计算机配置选择
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lao7

金虫 (正式写手)

[求助] 分子模拟计算机配置选择 已有2人参与

各位，小弟刚刚加入分子模拟行列，啥都不懂，现在手头只有25000元的款项，想购台用于分子模拟的计算机，一直纠结，问题如下：
    1）用高斯或者Amber软件，用来模拟生物分子。这样可能最低要16核CPU，32G内存的配置，这样的配置品牌机应该在至少3万以上，如果购买组装机只能买工程测试CPU，这样的CPU有很大的隐患，各位能否推荐一款25000元以下的计算机配置？
    2）酷龙AMD的CPU用来做分子模拟的性能怎么样？
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1楼 2014-01-19 14:35:12
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lao7

金虫 (正式写手)
引用回帖:
35楼: Originally posted by 明天再看看 at 2014-01-20 22:09:53
AMD的CPU并不适合做高斯，性能也就是同档次INTEL的一半速度，也不知道谁给你推荐的烂配置，2.5W够买最新的E5-2660 V2的产品了。GPU加速高斯支持吗？ 异想天开吧

已经付款了，主要考虑高斯和Amber应用。处理器用的是2个AMD 6272，显卡加速是用来计算Amber，Amber支持显卡加速。
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39楼2014-01-22 12:16:57
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lkui486

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lao7: 金币+2 2014-01-19 21:01:27
这个价格的话可以配Intel 至强 e5 2650两颗，内存金士顿ecc 32G，1TB WD黑盘，华硕Z系列主板。

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lao7
2楼2014-01-19 14:41:59
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lao7: 金币+2 2014-01-19 21:01:21
lao7: 金币+1, ★★★★★最佳答案 2014-01-19 23:18:22
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-21 18:12:08
本帖内容被屏蔽
3楼2014-01-19 16:14:41
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lao7

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by smutao at 2014-01-19 16:14:41
推荐国产 亿时空 的服务器
性价比超高 可以给你配的
楼主搞双路cpu 每个12线程 一共24个线程 应该够了

刚才问了一个公司，推荐两个配置，请楼主帮我看看哪个更合适？我用高斯和Amber分子模拟软件，请帮我参考一下，就听你意见了，明天下单：
方案1：AMD平台：

CPU        AMD OPTERON 6262He 1.6G 十六核 正式版                 2        19900
风扇        1944 针  服务器专用散热风扇                4       
内存        原装 正品原厂 4G DDR3 ECC  REGS                8       
硬盘        希捷ST  1T SATA 7200转 企业级硬盘                1       
显卡        NVIDIA GTX 680                       
主板        超微H8DGI-F 双路服务器主板 三个PCI-E 16X插槽                1       
超微塔式机箱电源        5个热插拔硬盘  塔式                                       1400W冗余电源（2+1）                                                                                          1       
                               
方案2：
CPU        Intel Xeon 5650 2.66G  六核十二线程 正式版                2        17500
风扇        1U 1366针  服务器专用散热风扇                2       
内存        原厂 正品 8G DDR3 ECC  REGS 1600                4       
硬盘        希捷ST  1T SATA 7200转 企业级硬盘                1       
显卡        Nvidia GTX 680                       
华硕准系统        2U 八盘位 热插拔 机架式 服务器机箱 1620W冗余电源（1+1） Intel 5500芯片组主板 四个PCI-Ｅ16X                 1
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4楼2014-01-19 20:57:36
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