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blastx和blastn结果不一致,如何确定预测结果 已有1人参与
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| 麻烦问一下我有一个序列在ncbi中blastx没有相似序列,blastn有相似序列,翻译的蛋白进行蛋白比对也有相似蛋白,这三个比较结果不一致,应该哪种方法比较可信? |
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sun_in_night
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【答案】应助回帖
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gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2014-01-18 16:09:39
dinghong1983: 金币+15, ★★★很有帮助 2014-01-18 20:05:45
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做蛋白一般就直接比蛋白序列,所得结果你也得看e-vale, identity,和query然后再决定这个结果可信否。而且有些蛋白序列比较之间相似很低,但是都有相同的保守序列或保守功能结构,这个也很可能是同一家族的蛋白。 你比核酸序列除非你在需要在核酸层面上做些什么。总的来说还是看你的目的而定。 |
2楼2014-01-18 06:39:52














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