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liumwei

新虫 (初入文坛)

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[交流] 生物信息系统BioInfoServ 5.03

BioInfoServ是一个基于Xubuntu LTS、Deepin Linux和Linux Mint构建和开发，以生命科学研究及生物信息分析为应用目的的生物信息平台系统。BioInfoServ具有良好的生物信息运行环境及用户分析界面，包含上百个生物信息应用软件，能有效地完成生物数据处理、序列比对分析、结构功能预测、分子模拟与进化研究、文献管理及论文写作等科研分析工作，是生命科学家或生物学家良好的科研分析平台。

BioInfoServ努力将更多、更好、更稳定、更成熟的生物软件工具（特别是生物信息工具）带给生物学家，满足他们在生物科学研究上对Linux系统的需求。同时，将尽可能地为中文桌面用户提供最好的本地化语言支持，将更人性化的桌面应用带给普通用户，使尽可能多的桌面用户走入Linux自由的王国里。

当前，BioInfoServ已经释放了5个版本，最新版本为5.03。此次已大量升级和增强了功能更多的生物信息软件，它们主要集中在“基因预测”（如 GeneMark Suit, Augustus）、“基因表达“（jExpress, Aglient, BioConductor）、“基因组分析”（Mauve, Artemis, GenomeComp, Appolo, Argo, BRIG, IGV, geWorkbentch, myRAST）、“R统计分析”（R-commander, Rattle, JGR, ape）、“序列组装”（SOAPDenovo, Newbler, Tablet, bwa, bowtie, samtools, Mothur）、“序列特征“（ELPH, profbval, chimerasLayer, Wigeon）、“作图/图形化工具”DNA-ploter, GNU-plot, qtiPlot, TreeView, Cluster），分子模拟及分子动力学（Accelry Discovery Studio、AotoDockTools、Raccoon、Amber、的）及ARB, BioKepler, Mega, BioPHP, BLST2KEGG和“生物信息软件手册”等方面，其对应的生物信息软件仓库也得到重新编译、打包、修正及更新。

此外，5.03还主要进行了如下工作：修复原系统出现在软件安装时会出现”无法找到的依赖性或已安装软件“的错误；解决了部分运行库缺失及低版本和高版本的要求；对生物信息软件菜单类别进行优化与修复；系统软件在线预览页面的建立；新的软件仓库地址（http://jaist.dl.sourceforge.net/ ... YuleFlying/bioinfo/）；更稳定下载站点的建立：

系统特性；系统预览
 系统手册；光盘下载
 安装配置；硬件驱动
 优化美化；生物信息