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gkd_0000

新虫 (正式写手)

[交流] 【求助】如何在castep中构建非化学计量比化合物的晶胞?

NaxCoO2是一种具有层状结构的非化学计量比化合物,其中CoO2层是由共棱的CoO6八面体构成的,钴位于变形的八面体中心。在CoO2层中间是Na离子层,钠离子分数占据由6个氧原子构成的三棱柱中心。当x值(0.11~0.9)不同时会形成不同的钠有序态,在一定的成分范围内(0.5~0.75),从XRD得到的基本结构是一样,但电子衍射花样却能反应出钠排列方式不同引起的差异。

我想问的问题是在castep中通过那些步骤可以构造出已知结构和成分的非化学计量比的晶胞。
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成功地证实种种大胆的设想和揣测,这难道不正说明我们毕生的工作是无可非议和值得自豪的吗?--柯南道尔
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lvweiqiang111

捐助贵宾 (小有名气)

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gkd_0000(金币+2,VIP+0):能说具体一点吗?是不是先按一种空间群输入结构、填入原子,然后解除周期性去掉不想要的原子,然后再变成周期性结构?
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版。
我认为通过建立不同大小的超胞然后加入Na可以在一定范围内实现,但是Na到底放在何处才与真实情况接近需要你去尝试!
还有一种方法就是采用混合原子,比用将模型中的Co分为xNa和1-xCo,但你提到Na位于CoO2层中间,估计模拟结果不太准确,但作为一个选项不妨一试!
2楼2008-01-10 22:08:32
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y1ding

铁杆木虫 (著名写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版。
naxcoo2里面的na有序
嘿嘿,是中科院的吗?
prb04,07年有两篇文章,nature07有一篇,预印本上07年9月台湾又挂了一篇(具体投哪不知道)
这个课题研究的已经很多了。
3楼2008-01-10 23:59:46
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gkd_0000

新虫 (正式写手)

俺不是中科院的
这个课题确实已经研究非常多,不过已经变成了一个scientific interest,对理论研究非常有意义,材料本身似乎并不实用。

[ Last edited by gkd_0000 on 2008-1-11 at 09:50 ]
成功地证实种种大胆的设想和揣测,这难道不正说明我们毕生的工作是无可非议和值得自豪的吗?--柯南道尔
4楼2008-01-11 09:45:14
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gkd_0000

新虫 (正式写手)

lvweiqiang111 能说具体一点吗?是不是先按一种空间群输入结构、填入原子,然后解除周期性去掉不想要的原子,然后再变成周期性结构?
成功地证实种种大胆的设想和揣测,这难道不正说明我们毕生的工作是无可非议和值得自豪的吗?--柯南道尔
5楼2008-01-11 09:48:25
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lvweiqiang111

捐助贵宾 (小有名气)

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gkd_0000(金币+5,VIP+0):非常感谢您的帮助。如果一开始输入的结构里面钠和钴的比例是1:1,我可以在里面删掉特定的钠原子吗,我试了一下好像删掉一个原子,则跟它等价的位置上的同种原子也会被删掉
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版。
先建立CoO2晶胞,再作超胞化处理,将对称性变为P1,一般超胞化后就是P1了,然后再add atom,加入Na,根据要加入的位置输入Na原子坐标,比如要想使X=0.1,那就在一个含10个Co、O八面体的超胞中加入一个Na。
以上仅是个人建议,不一定合理,还请高手批评指正!
6楼2008-01-11 13:27:15
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gkd_0000

新虫 (正式写手)

非常感谢lvweiqiang111。
如果一开始输入的结构里面钠和钴的比例是1:1,我可以在里面删掉特定的钠原子吗,我试了一下好像删掉一个原子,则跟它等价的位置上的同种原子也会被删掉。在这之前已经make P1 了。另外,构造完的超单胞使之成为周期性结构应该怎么操作?

[ Last edited by gkd_0000 on 2008-1-11 at 14:39 ]
成功地证实种种大胆的设想和揣测,这难道不正说明我们毕生的工作是无可非议和值得自豪的吗?--柯南道尔
7楼2008-01-11 14:38:31
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buble

金虫 (著名写手)

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gkd_0000(金币+5,VIP+0):我试一下,谢谢!
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版。
一般makeP1以后就不会一次删除多个原子
用find symmetry里的impose symmery可以加上周期性
8楼2008-01-11 16:28:12
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匿名

用户注销 (著名写手)

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gkd_0000(金币+2,VIP+0):谢谢您的讨论!
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版。
本帖仅楼主可见
9楼2008-01-11 20:37:17
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gkd_0000

新虫 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版。
引用回帖:
Originally posted by lirwx at 2008-1-11 20:37:

关键是na 的位置。这个体系我也算过,
na 位置有好几种,几种不同的位置,和位置组合算出来差别很大!


的确是的,这种材料只合适搞理论

有人计算了82种有序结构,并得到了大概14种ground state ordered pattern,并且其结果跟低温电子衍射照片基本吻合。这个工作量非常大,光建模型就得花费很多时间。

lirwx兄,能细致的谈一下你在这方面的经验吗?
成功地证实种种大胆的设想和揣测,这难道不正说明我们毕生的工作是无可非议和值得自豪的吗?--柯南道尔
10楼2008-01-12 12:39:24
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