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最后一根火柴

铜虫 (初入文坛)

[求助] 真菌内部转录间隔区ITS1-2序列大约有多少个bp? 已有1人参与

各位老师,小弟现在准备用二代测序的方法做粪便中真菌的检测,目前遇到的困惑如下:
    1、真菌内部转录间隔区ITS1-2序列大约有多少个bp?
     2、我目前联系的公司是使用illumina的方法测序,可以测的长度大约300bp。我担心ITS1-2序列长度会超过300bp,这样对结果分析影响大吗?我现在已经将样本交给对方了,有点担心这个问题!希望各位老师不吝赐教!感激不尽!
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1095314666

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
序列长度在500-750bp之间。
路在脚下。
2楼2014-01-12 06:56:29
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1095314666

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

建议测序较长的公司,如果测序太短,估计两端测序都不能测出全长。
路在脚下。
3楼2014-01-12 15:34:20
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