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gamess简介【转】
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不知道有多少人用过或者听说过GAMESS, 但GAMESS(USA)可能是现在使用的最广泛的免费量化软件之一。本文简要介绍GAMESS(USA)的历史，以及在Windows下的安装及使用。 GAMESS的历史 首先可能有必要介绍一下GAMESS的历史。GAMESS现在有两个分支，GAMESS(USA)和GAMESS-UK。1977年，美国National Resources for Computational Chemistry (NRCC)开始了一个名为GAMESS(General Atomic and Molecular Electronic Structure System, 通用原子分子电子结构系统)的研究项目。早期的GAMESS是由以HONDO 5(由Michel Dupuis开发)为主的很多个软件合并而成。NRCC的GAMESS项目于1981年9月30日中止。之后GAMESS出现两个分支：由英国CCLRC Daresbury实验室开发的GAMESS-UK和现在由美国Iowa State University Mark Gordon研究组开发的GAMESS(USA)。这两个分支均在1981年版的GAMESS基础上做了大量的修改，各自加入了很多新的功能，现在已经分别发展为两个截然不同的量子化学软件。 除非特别说明，以下内容中GAMESS均指GAMESS(USA)。 GAMESS for Windows的多种版本 GAMESS现在支持多种硬件平台，初学者可以使用Windows版本作为练习。运行于Windows环境下得GAMESS也有多个版本，除了针对64位系统特殊编译的版本之外，比较常见的可能包括Nuno Bandeira编译的未经改动版的WinGAMESS（最新版：2005年6月版），CambridgeSoft编译的版本（最新版：2003年6月版。只能与ChemOffice 6.0+ 一起使用），以及Alex Granovsky开发的PC-GAMESS(PC-GAMESS在一较老的GAMESS版本基础上，加入了一些新的功能，并为在Windows环境特别优化了一部分代码)。 安装及运行 Nuno Bandeira版本的WinGAMESS安装很简单，但要注意目录名不能出现空格或中文字符，最好安装在默认目录 C:\WinGAMESS\ 下。 安装完成后，运行WinGAMESS目录下的batmaker.exe可以编辑计算批处理文件，然后运行jobs.bat就可以进行计算了。 进行行测试计算 GAMESS文档中包括30个简单的输入文件例子。一般比较简单的计算(HF,DFT,MP2,CCSD,CIS,MCSCF，计算能量，能量梯度，几何优化，溶剂化等等)，都可以在这些例子里找到。如果需要查阅某关键词的详细用法，可以查阅文档。 编辑输入文件--分子结构 很多软件都可以编辑GAMESS的输入文件，比较常用的例如Molden, WebMO, Molekel。GAMESS官方网站上推荐使用Ghemical-GMS作为图形化的编辑器(http://www.uiowa.edu/~ghemical/ghemical-gms.shtml)。如果购买了ChemOffice软件(6.0以上版本)，也可以使用Chem3D来编辑GAMESS输入文件（可以保存输入文件，再用WinGAMESS打开运行，此时可以不用CambridgeSoft编译的GAMESS）。 编辑输入文件--基组 如果懒得读文档，常用的基组在前面提到的30个输入例子里面都有涉及，例如，6-31G基组对应的输入文件应该写成： $BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 $END 常见错误 计算例子时如果出现错误，很有可能是内存不足(检查输入文件中MEMORY关键字)。也有可能旧的例子与新版本的程序不兼容。实际计算中大部分错误都是由输入文件出错造成的。更复杂的错误可以到GAMESS邮件列表中讨论。 外部链接 GAMESS(USA)官方网站（包括文档，输入例子，下载） http://www.msg.ameslab.gov/GAMESS/GAMESS.html GAMESS(USA)用户邮件列表 http://www.gl.ciw.edu/gamess/ 高斯基组数据库（可生成GAMESS输入格式的各种基组） http://www.emsl.pnl.gov/forms/basisform.html |
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brover2楼
2008-01-09 09:27
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