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vechov

金虫 (正式写手)

[交流] Chem 3D for structural optimization ?

anybody konw Semiempirical calculations  carried out by employing MM2 (Chem 3D) for structural optimization and PM3 (Cauche Company) for orbital analysis?

[ Last edited by csfn on 2008-1-10 at 15:04 ]
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better
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wjmed

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
vechov(金币+5,VIP+0):thanks very much for your useful help. i'm a layman of this field, do you have some manuals in detail
用 mm2进行半经验计算,推荐你使用MOPAC,从1981年由J. J. P. Stewart开始开发,最早基于Dewar和Thiel的NDDO方法。在发布了MOPAC 7.0之后,MOPAC成为Fujitsu公司的商业软件Fujitsu MOPAC。但是15年后,作者在MOPAC 7.0的基础上重新开始了非商业版本MOPAC的开发,用FORTRAN 90/95语言进行了改写,并加入了很多新的功能。MOPAC 2007(即MOPAC 7.2)功能相当于商业程序Fujitsu MOPAC 2002,增加了PM6,但缺少MINDO/3,PM5,解析导数,Tomasi溶剂模型和系间穿越。
需要申请执行账号和密码(运行时需要)。学术用户可以在线申请,免费使用,但不提供技术支持。
申请地址:http://openmopac.net/index.html

而且,windows版本(Winmopac)的也很好用,是免费的。
下载链接:
http://www.psu.ru/science/soft/winmopac/

另外,vega zz软件包中也整合了mopac的功能,提供图形界面,对学术用户免费,推举使用。
网址: http://www.ddl.unimi.it/vega

最后再提一句,如果你确实对chem3d的半经验计算感兴趣,mopac2007和gamess都在chem3d中有接口,可以使用。不过gamess申请起来可比较麻烦,密码一层嵌套一层,呵呵。

参考
http://www.quantumchemistry.net/Programs/M/200705/452.html

[ Last edited by wjmed on 2008-1-7 at 15:29 ]
Timeandtidewaitsfornoman!
2楼2008-01-07 15:18:43
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vechov

金虫 (正式写手)

如果是下面这一化合物,怎么计算它的分子长宽,HOMO,LUMO轨道之类的,
可以教我具体操作吗
better
3楼2008-01-07 17:03:49
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renwenpo

金虫 (小有名气)

我也想知道在分子模拟软件中怎么计算分子三维结构的长、宽、高?软件比如是Hyperchem或Gaussian
4楼2008-01-09 20:07:33
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dongping001

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
vechov(金币+5,VIP+0):谢谢先,学习中
可以将计算好的分子结构存成.chm,用chem3d可以得到任意两个原子之间的距离,可以给我发小纸条把email发过来,我给你发一个chem3d使用的ppt,就能计算:“分子长宽,HOMO,LUMO轨道之类的”
5楼2008-01-11 20:53:39
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