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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 用Seqin向NCBI提交序列 Seqin检查序列有Error 怎么处理？
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ploriers2009

新虫 (小有名气)

[求助] 用Seqin向NCBI提交序列 Seqin检查序列有Error 怎么处理？ 已有1人参与

用Seqin向NCBI提交序列 Seqin检查序列有Error ：
WARN：SEQ_FEAT   FeatContentDup
             Duplicate feature FEATURE: CDS: maturase K [lcl l K3:<1->500] ->[lcl l K3_1] (CONTEXT K3)
            The intervals on this feature are identical to another feature of the same type, and the label and comment are also identical. This is likely to be an error in annotating the record. Not that GenBank format suppresses duplicate features, so use of Graphic view is recommended.
REJECT: SEQ_FEAT   MultipleCDSproducts
              Same product Bioseq from multiple CDS features  FEATURE: CDS: maturase K [lcl l K3:<1->500] ->[lcl l K3_1] (CONTEXT K3)
             More than one CDS feature points to the same protein product. This can happen with viral long terminal repeats (LTRs), but GenBank policy is to have each equivalent CDS point to a separately accessioned protein Bioseq.
    我检查了这个序列，他的注释跟其他正确格式的序列没有什么差异。就不知要在哪里改什么了。
求大神指导，先谢啦！
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1楼 2014-01-02 15:56:23
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ploriers2009

新虫 (小有名气)
木有人遇到过这样的问题么？
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2楼2014-01-04 15:51:30
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IMichaelhan

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

warn 指的是你序列标注时有一个基因标注重复了，但是sequin这个软件不能删除标注只能添加，所以解决的办法只能是重新标注
赞一下 回复此楼
3楼2014-12-15 14:27:06
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