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拟南芥的芯片映射数据库,该如何计算基因的表达水平
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从TAIR上下载了affy的芯片数据库,该芯片数据库给出的是映射到基因组上的数据,样本入下: array_element_name array_element_type organism is_control locus description chromosome start stop 11986_at.408.277 oligonucleotide Arabidopsis thaliana no AT3G61050 Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein 3 22600585 22600609 想计算每条基因的表达水平值,请教有这方面知识的虫友,具体怎么计算,或者有什么样的参考文献。 |
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