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zyhou

专家顾问 (文坛精英)

[交流] 如何计算分子的动力学直径

为了讨论分子筛孔道对某些有机反应的择形性,想计算几个同分异构体的动力学直径。求助各位什么软件可以计算?或者在什么地方可以查到?
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雁过无痕

至尊木虫 (职业作家)

资深木虫

2026年招收硕士2名(可调剂),博士1名。招收药物固态化学教学科研人员(博士后或特聘副教授)各一名。
2楼2007-12-29 11:03:08
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zyhou

专家顾问 (文坛精英)

看来很难!再顶一下!
3楼2007-12-30 14:00:55
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2008SCI2008

★
buffaloli(金币+1,VIP+0):多谢!新年好!看过了,只有几种。
高滋教授的一篇中文文献提到了:
《分子尺寸与沸石分子筛择形选择性》石油学报(石油加工)

不知道会不会对你有帮助 呵呵
4楼2007-12-30 16:02:16
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zyhou

专家顾问 (文坛精英)

谢谢!看到了!正在学习!
5楼2007-12-31 17:20:02
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雁过无痕

至尊木虫 (职业作家)

资深木虫

谢谢4楼的资料
2026年招收硕士2名(可调剂),博士1名。招收药物固态化学教学科研人员(博士后或特聘副教授)各一名。
6楼2007-12-31 20:20:51
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smallfolk

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
buffaloli(金币+1,VIP+0):多谢!新年好!能具体一点吗?
buffaloli(金币+3,VIP+0):多谢!辛苦了,happy new year!
做这方面的计算还是很多的。

如果简单的算,化学键角,建长,范德化半经就可以算出来。

可以算最小横截面直径。

也就是利用lenord-jones函数里面的动力学直径来算。

如果利用一些专业软件,还是比较容易算出来的。

关键看你的客体分子是什么,精确度的要求,这决定你采用的手段。



如果需要详细的资料,可以发信给我。

高兹的那个文献还是仔细看了的,我觉得他还是比较初级的模拟,用键长,键角,和几何方法,具体数据都可以查到。这种方法,在国外很早就有了。

给你几个文献看看吧:

Fuel 83 (2004) 2183–2188


Journal of Catalysis 195, 227–236 (2000)

http://pubs.acs.org/cgi-bin/abst ... /abs/ja973906m.html

http://www.sciencedirect.com/sci ... c8033d8a916a6c7819a

关于这方面模拟的看法,

客体分子和分子筛孔道,如果想做复杂精细,还是有非常多工作去做的。很多做吸附,势能面的工作的,其中最基本的就是客体分子的模拟,很多大型化学计算类的软件都可以做。

如果我去做,两个路子。
1. 简单,方便,不花钱的方法
2. 精确的方法,把化学键的震动考虑进去,因为,T对于客体分子的大小影响非常大,很少有人把温度的影响考察进去。(当初自己想用material studio去做,可是没时间了,毕业之后也就扔了。)

[ Last edited by smallfolk on 2007-12-31 at 21:29 ]
7楼2007-12-31 20:36:32
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zyhou

专家顾问 (文坛精英)

谢谢楼上这么详细的回答!祝你新年好!斑竹应该多给几个金币!

具体情况是这样的:

我们试验中发现:beta分子筛对于甲苯和甲醛缩合制备4,4-二甲基二苯甲烷具有最高的反应活性和目的产物选择性,文章也已经发表!但是在写博士论文的时候,有人建议对这个现象进行具体一些的理论分析,不能简单的以分子筛的择形性来解释,应该加上一些目的产物的动力学直径等等方面的内容,这样会更好看一些!

谢谢你的帮助,如能给一些具体的提示或者计算软件就更好了!

我们用ChemOffice模拟了一下,也看到了这个分子优化以后的三维图形,但是没有看到整个分子的直径,只有各个键长、键角的数据。
8楼2008-01-01 10:14:20
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