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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 关于MS的atom selection，使用性质筛选，总是出错
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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gx730

金虫 (正式写手)

[求助] 关于MS的atom selection，使用性质筛选，总是出错 已有2人参与

我想问一下，在使用MS的atom selection时候，我设置的是 选择性质是 电荷，下面选的是 equal to 0.139，
但是选择的时候并没有根据电荷来选中我要选择的电荷为0.139 的原子。
不知道怎么回事，希望大家给出出主意，谢谢
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1楼 2013-12-13 14:42:02
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

sf127710627

铜虫 (初入文坛)
★ ★
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2013-12-14 08:55:00
gx730(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-31 21:28:31
引用回帖:
3楼: Originally posted by gx730 at 2013-12-13 17:28:12
我已经把分子的电荷都计算出来了，而且都用label 显示了。所以采用0.139去筛选的。...

你property要先選charge，右手邊要先選select all，下面equal to 0.139，最後在選下面的select應該就可以了
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4楼2013-12-13 21:42:54
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Voland

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gx730: 金币+1, 谢谢您的帮助 2013-12-14 17:46:52
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2013-12-15 09:36:56
gx730(月只蓝代发): 金币+2, 鼓励交流！ 2014-05-31 21:28:42
周期性分子也会出现这种情况……有一个解决办法就是不用equal这个命令，而使用Inclusive Range，然后把范围缩得很小，比方说电荷量为0.3245 e，那么可以写成从0.3244-0.3246，只要你的电荷不是很多都在这种范围内，就能一下子选出来（要是大都在这个范围就进一步缩小呗，反正MS支持的精度挺高的）。
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Yağma！Yağma！Yağma！
6楼2013-12-14 17:11:51
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普通回帖

sf127710627

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gx730: 金币+1, 谢谢回复 2013-12-13 17:41:06
月只蓝: 金币+1, 欢迎提问交流 2013-12-13 18:36:23
你可以在先在你的圖裡面按右鍵選label，?K?难e面挑charge去看，或許裡面的電荷都是0，那你自然選不到0.139的原子
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2楼2013-12-13 15:59:30
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gx730

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sf127710627 at 2013-12-13 15:59:30
你可以在先在你的圖裡面按右鍵選label，?K?难e面挑charge去看，或許裡面的電荷都是0，那你自然選不到0.139的原子

我已经把分子的电荷都计算出来了，而且都用label 显示了。所以采用0.139去筛选的。
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3楼2013-12-13 17:28:12
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gx730

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sf127710627 at 2013-12-13 21:42:54
你property要先選charge，右手邊要先選select all，下面equal to 0.139，最後在選下面的select應該就可以了...

谢谢您的回复！
我反复试了，还是不行。
总觉得是不是软件出问题了，总是不能按性质选中原子。明明就是这个格式的，苦闷
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5楼2013-12-14 09:55:39
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gx730

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by Voland at 2013-12-14 17:11:51
周期性分子也会出现这种情况……有一个解决办法就是不用equal这个命令，而使用Inclusive Range，然后把范围缩得很小，比方说电荷量为0.3245 e，那么可以写成从0.3244-0.3246，只要你的电荷不是很多都在这种范围内， ...

这个方法我也试过了。但我的这个分子吧就只有几个原子可以用Inclusive Range选中，其他的失效。
你说奇怪不
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7楼2013-12-14 17:48:19
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Voland

金虫 (小有名气)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-15 09:37:03
引用回帖:
7楼: Originally posted by gx730 at 2013-12-14 17:48:19
这个方法我也试过了。但我的这个分子吧就只有几个原子可以用Inclusive Range选中，其他的失效。
你说奇怪不...

分子不大就手动自己选吧，还有一个办法就是换一个文件格式，.cif或者.mol、.pdb，如果照你所说是这种奇怪的情况，那你不如换一个文件格式试试。
这都不行而且分子又太大觉得麻烦就重装，不排除软件的问题。
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Yağma！Yağma！Yağma！
8楼2013-12-14 17:55:20
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gx730

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by Voland at 2013-12-14 17:55:20
分子不大就手动自己选吧，还有一个办法就是换一个文件格式，.cif或者.mol、.pdb，如果照你所说是这种奇怪的情况，那你不如换一个文件格式试试。
这都不行而且分子又太大觉得麻烦就重装，不排除软件的问题。...

呜呜   我有500多个分子啊
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9楼2013-12-14 18:02:44
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Voland

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by gx730 at 2013-12-14 18:02:44
呜呜   我有500多个分子啊...

改文件类型能行么？
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Yağma！Yağma！Yağma！
10楼2013-12-14 18:04:10
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