24小时热门版块排行榜    

查看: 618  |  回复: 6
当前主题已经存档。

yanghai1001

金虫 (正式写手)

[交流] 求助:MOPAC及其CAChe问题

本人是量子化学菜鸟,有哪个高手用过MOPAC和CAChe软件算过,point charges和Frontier electron density 进来指教下我吧,在一篇98年的文献上看到计算氨基酸point charges,Frontier electron density的,我在chemoffice 2002自带的MOPAC算了下,就是不能重复文献值.
老板逼得急,我以前都不是做量化的,现在自己钻研了几天都没有结果,苦啊,刚才还被老板骂了,容易吗我

[ Last edited by yanghai1001 on 2007-12-27 at 15:22 ]
回复此楼
玩转地球!!!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanghai1001

金虫 (正式写手)

冒一个人理我,5555
玩转地球!!!
2楼2007-12-26 21:50:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版解答问题。
Mopac 中没有 CAChe,两者应该调过来,呵呵

要重复别人的计算,首先要把结构优化的与别人的一样才行,否则是没有办法重复别人的结果的。

你可以把那篇文献也贴出来,把你的计算过程写清楚,这样别人才可能知道你的问题在哪里了。
3楼2007-12-27 08:55:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanghai1001

金虫 (正式写手)

Molecular orbinal calculations wereperformed using the CAChe system (by Sony/TektronixCorporation) from the MOPAC version 6. These MO calculations were carried out to the single determinant (Hartree-Fock) level and optimal geometries of conformationalminima were obtained at the AM1 level.
玩转地球!!!
4楼2007-12-27 15:15:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanghai1001

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by snoopyzhao at 2007-12-27 08:55:
Mopac 中没有 CAChe,两者应该调过来,呵呵

要重复别人的计算,首先要把结构优化的与别人的一样才行,否则是没有办法重复别人的结果的。

你可以把那篇文献也贴出来,把你的计算过程写清楚,这样别人才可能知 ...

非常感谢2楼的,文献上具体的算法,我粘在上面了,望兄弟不吝赐教!!!
玩转地球!!!
5楼2007-12-27 15:17:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,希望继续关注计算模拟版
文章的意思是,结构是用 am1 优化的,用了 1scf 这个关键词

但问题是,他的结构是什么样子的,我们还是不清楚,因为初始结构不同,结果也不会一样,呵呵,不过你可以试试,先用 am1 优化结构后再试着计算一下就是了,用 mopac6 或其它的 mopac 都不会有影响的。
6楼2007-12-27 21:19:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanghai1001

金虫 (正式写手)

我用的chemoffice 7.0自带的MOPAC,在chem 3D里面经过minimize energy以后再计算的,我现在还有一个问题就是系统chem 3D好象没有直接计算point charges,  Frontier electron density这两个选项?
玩转地球!!!
7楼2007-12-27 23:17:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yanghai1001 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见