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生成随机坐标以搜索全局极小点和可能的几何构型的小程序
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一个高手编的程序，我在这里借花献佛 搜索全局极小点和可能的几何构型是计算化学中一个重要的问题, 下面的小程序可以帮助大家去进行相当系统的搜索. 编程思想: (1)生成随机坐标(3n个坐标),随机数产生命令生成, 立方体大小由自己给参数设定. (2)抛弃不合理的坐标: 两个原子之间的距离< 0.7A, 或者某个原子距离所有原子的距离都> 2.0A. (3)调用Gaussian03程序或其它程序进行量子力学粗优化(一般用lsda/sto-3g), 得到合理的可能的结构. 本程序是一个awk程序:gxyz.awk, 需要一个输入文件,见例子B6.txt, 输入的命令是(在Linux下): gawk -f gxyz.awk B6.txt 注意让命令后台运行, 因为要花很长的时间. 本站付金币下载见附件 也可以到下面的链接免费下载，把鼠标分别放在“gxyz.awk”和“B6.txt“可以找到链接 http://mail.sxu.cn/blog/index.ph ... uid=4062&id=228 [search]几何构型搜索[/search] [ Last edited by hairan on 2007-12-25 at 21:27 ] |
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