应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP中脚本程序问题
152/2返回列表上一页12
查看: 2567  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

aminibuck

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by djh434325996 at 2013-12-06 11:30:00
其他几个CAR不用写在PBS脚本里面
for i in 250 300 350 400 450 500 550 600
do
cat > INCAR <<!
System = Si
ENCUT = $i
ISTART = 0
ICHARG = 2
ISMEAR = 0
SIGMA = 0.1
PREC = Accurate
!
...

直接写在INCAR文件里？
赞一下 回复此楼
11楼2013-12-06 12:04:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

djh434325996

木虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by aminibuck at 2013-12-06 12:04:46
直接写在INCAR文件里？...

两个感叹号之间的内容就是INCAR的内容！（ cat > INCAR <<! 和 ! 之间的内容就是你的INCAR）
你可以先去看看shell语言！
赞一下 回复此楼
12楼2013-12-06 16:01:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aminibuck

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by djh434325996 at 2013-12-06 16:01:13
两个感叹号之间的内容就是INCAR的内容！（ cat > INCAR <<! 和 ! 之间的内容就是你的INCAR）
你可以先去看看shell语言！...

好的，非常感谢
回复此楼
13楼2013-12-06 16:12:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

djh434325996

木虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by aminibuck at 2013-12-06 16:12:30
好的，非常感谢...

14楼2013-12-06 20:21:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Vaucanson

金虫 (小有名气)
把我的PBS文件贴出来给大家看看，针对的是侯老师的有关测试截断能的那个例子。
#PBS -N vaspjob
#PBS -l nodes=1:ppn=8
#PBS -q csuliaofei
#PBS -j oe
#PBS -l walltime=1000:00:00

cd $PBS_O_WORKDIR
NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`

rm WAVECAR
for i in 150 200 250 300 350 400
do
cat >INCAR<<!
SYSTEM=Si-Diamond
ENCUT=$i
ISTART=0;ICHARG=2
ISMEAR=-5
PREC=Accurate
!
echo "a=$i"

source /public/software/mpi/openmpi1.4-pgi.sh
mpirun -np $NP -machinefile $PBS_NODEFILE /public/software/qchem/vasp/vasp-openmpi-pgf90

E=`grep "TOTEN" OUTCAR| tail -1| awk '{printf "%12.6f \n", $5}'`
echo $i $E>>comment
done
赞一下 回复此楼
15楼2013-12-13 14:14:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 aminibuck 的主题更新
152/2返回列表上一页12
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学调剂0703 +7 啊我我的 2026-03-11 7/350 2026-03-15 23:03 by 凌千颂111
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 309求调剂 +4 花与叶@ 2026-03-10 4/200 2026-03-14 21:26 by a不易
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 312求调剂 +6 陌宸希 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:40 by JourneyLucky
[考研] b区环境工程求调剂 +4 Maps1 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:23 by JourneyLucky
[考研] 318求调剂 +3 李新光 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:21 by JourneyLucky
[考研] 332求调剂 +3 zjy101327 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:48 by JourneyLucky
[考研] 工科，求调剂 +3 我887 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:39 by JourneyLucky
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 302求调剂 +6 负心者当诛 2026-03-11 6/300 2026-03-13 16:11 by JourneyLucky
[考研] 一志愿211化学学硕310分求调剂 +8 努力奋斗112 2026-03-12 9/450 2026-03-13 15:41 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 0856化学工程280分求调剂 +4 shenzxsn 2026-03-11 4/200 2026-03-13 11:55 by ymwdoctor
[考研] 296求调剂 +3 大口吃饭 身体健 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:31 by 学员8dgXkO
[考研] 化工学硕306求调剂 +9 42838695 2026-03-12 9/450 2026-03-13 10:16 by houyaoxu
[考研] 270求调剂 085600材料与化工专硕 +3 YXCT 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:13 by houyaoxu
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生，2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
[考研] 283求调剂，材料、化工皆可 +8 苏打水7777 2026-03-11 10/500 2026-03-13 09:06 by Linda Hu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭