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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请教freq=readisotopes计算同位素效应的输入文件设置？
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
引用回帖:
5楼: Originally posted by 些小 at 2013-12-06 19:24:01
谢谢你的解答，很清楚。
我按照你的方法重新建立了输入文件。果然不报错了。但是计算结果出来，和没有定义同位素是一样的。我想计算H和D的不同IR谱图，我看文献，说freq结果是有区别的，但是我算出来是 一样的。请 ...

其实，你贴log文件附件是最省事的，可以直接用GView来看振动，你这样贴文字看起来很困难。
就说说“freq结果是有区别的，但是我算出来是 一样的”吧。
因为你仅对10-11-12三个H原子改成D，因此，你需要寻找对应这三个原子的振动模式来对比频率，与此三原子无关的振动，频率改变当然会非常小。举例而言，
第2个振动频率，对应甲基旋转，原频率229.05，氘代后变为170.18
第6个振动，对应的剪式振动，原频率797.77，氘代后为671.51
第7个振动，11号H的摆动，原频率857.49，氘代后为742.31
第17个振动，原频率1409.38，氘代后对应第15个频率1127.46
……
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
11楼2013-12-09 14:04:24
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
引用回帖:
2楼: Originally posted by marson at 2013-12-02 18:14:18
--------------------------------------------------------------------------------------
# freq=(noraman,readisotopes) ub3lyp/6-31++G(d,p) opt

Title Card Required

1 2
O                  4.5343 ...

向高手求助，文章审稿人让我计算Equilibrium isotope effects，在小木虫里搜到了kinetic isotope effect (KIE)的帖子，但是两者的计算公式不一样。也有用readisotopes计算同位素效应的帖子，也不确定是不是适应于Equilibrium isotope effects。
请问Equilibrium isotope effects该如何计算？用高斯可以计算吗？谢谢
请教freq=readisotopes计算同位素效应的输入文件设置？
Equilibrium isotope effects(EIE).jpg


请教freq=readisotopes计算同位素效应的输入文件设置？-1
kinetic isotope effect (KIE).png
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
12楼2014-02-17 17:43:00
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangmt at 2013-12-03 09:17:28
1、readisotopes不是不可以用，但是属于已被废弃，不建议使用。如果你依然喜欢用，还是可以用的，包括你算同位素效应，用法不变。
2、新的使用方法（其实已经不新了），除了温度、压强新增了关键字，对于同位素则更 ...

向高手求助，文章审稿人让我计算Equilibrium isotope effects，在小木虫里搜到了kinetic isotope effect (KIE)的帖子，但是两者的计算公式不一样。也有用readisotopes计算同位素效应的帖子，也不确定是不是适应于Equilibrium isotope effects。
请问Equilibrium isotope effects该如何计算？用高斯可以计算吗？谢谢
请教freq=readisotopes计算同位素效应的输入文件设置？-2
Equilibrium isotope effects(EIE).jpg


请教freq=readisotopes计算同位素效应的输入文件设置？-3
kinetic isotope effect (KIE).png
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
13楼2014-02-17 17:44:52
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独孤立啊

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangmt at 2013-12-03 09:17:28
1、readisotopes不是不可以用，但是属于已被废弃，不建议使用。如果你依然喜欢用，还是可以用的，包括你算同位素效应，用法不变。
2、新的使用方法（其实已经不新了），除了温度、压强新增了关键字，对于同位素则更 ...

您好，关于计算同位素，除了在input文件中修改iso外，还需要在freq中添加什么关键词吗？我用的是Gaussian 03，如果不添加关键词，同位素并没有被读取，但是添加了freq=readisostopes后，报L101错误，详情为WANTED A FLOATING POINT NUMBER AS INPUT.
  FOUND A STRING AS INPUT.
Atom number 1, atomic number 8: [16]                                            

请问这是什么原因呢？期待你的回复
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14楼2017-10-19 12:32:31
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