应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请教freq=readisotopes计算同位素效应的输入文件设置？
51/1返回列表
查看: 3554  |  回复: 13
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

些小

铜虫 (初入文坛)

[求助] 请教freq=readisotopes计算同位素效应的输入文件设置？

用高斯03计算同位素效应。
计算CH2=CH-CH2-CD3
输入关键词freq=readisotopes.
下面分子坐标后加温度压强，再加原子量。
总是出错，显示failed to get reasonable mass for atom 1 atomic number 6。
我再三核对了输入文件的元素顺序应该没有错。
输入文件的顺序为
c
c     1
c      2
c      3
H      1
H      1
H      2
H      3
H      3
H      4
H      4
H      4
我后面定义原子数的时候写的如下
12
12
12
12
1
1
1
1
1
2
2
2
计算就总是出错。翻看旧帖。有人说readisotopes的关键词如果只是定义压强和温度已经废弃不用。但是我要算同位素效应。请各位指教。
另外如果我把readisotopes的关键词去掉，只是在后面写上
12
12
12
12
1
1
1
1
1
2
2
2
计算可以通过。但是freq结果和没有定义D用H时是一样的。翻开旧帖应该是freq结果有区别。
所以请教如何定义同位素。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Materials Modeling

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2013-12-02 16:21:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

些小

铜虫 (初入文坛)
out文件，H的
                     1                      2                      3
                     A                      A                      A
Frequencies --   107.9189               229.0536               316.3839
Red. masses --     2.2443                 1.0865                 1.7965
Frc consts  --     0.0154                 0.0336                 0.1059
IR Inten    --     0.0755                 0.0338                 0.5647
Raman Activ --     2.4488                 0.2031                 1.0917
Depolar (P) --     0.7469                 0.5933                 0.6741
Depolar (U) --     0.8551                 0.7448                 0.8053
Dip. str.   --     2.7925                 0.5878                 7.1207
Rot. str.   --     2.1783                 0.8933                 7.3278
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   6     0.11   0.07   0.14     0.02  -0.04   0.03    -0.03  -0.06   0.00
   2   6    -0.02  -0.07  -0.16    -0.01   0.03   0.00    -0.10   0.05  -0.08
   3   6     0.02  -0.01  -0.13    -0.01   0.03  -0.04    -0.03   0.14   0.06
   4   6    -0.11   0.00   0.12    -0.01  -0.02   0.01     0.14  -0.07   0.02
   5   1     0.09   0.04   0.16     0.00  -0.07   0.10    -0.21  -0.32  -0.17
   6   1     0.24   0.22   0.40     0.08  -0.08  -0.03     0.23   0.08   0.27
   7   1    -0.14  -0.21  -0.40    -0.05   0.06   0.04    -0.30  -0.12  -0.37
   8   1     0.01  -0.08  -0.24    -0.03   0.02  -0.07    -0.09   0.17   0.09
   9   1     0.16   0.11  -0.13     0.01   0.05  -0.04    -0.04   0.05   0.08
  10   1    -0.12   0.10   0.28     0.39  -0.28  -0.29     0.27  -0.05   0.11
  11   1    -0.05   0.08   0.14    -0.15  -0.25   0.52     0.01  -0.26  -0.16
  12   1    -0.26  -0.17   0.13    -0.25   0.43  -0.15     0.32  -0.17   0.08
                     4                      5                      6
                     A                      A                      A
Frequencies --   433.8649               655.0954               797.7666
Red. masses --     1.9889                 1.4739                 1.1804
Frc consts  --     0.2206                 0.3727                 0.4426
IR Inten    --     0.8169                10.5978                 3.0404
Raman Activ --     3.5337                 2.0634                 0.3315
Depolar (P) --     0.2276                 0.1444                 0.6850
Depolar (U) --     0.3708                 0.2524                 0.8131
Dip. str.   --     7.5114                64.5383                15.2041
Rot. str.   --    -5.1765                 3.4859               -11.4390
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   6     0.16  -0.07  -0.01     0.04  -0.01  -0.03     0.02   0.01  -0.01
   2   6     0.05   0.15  -0.08     0.09   0.07   0.14    -0.01  -0.02  -0.05
   3   6    -0.10  -0.03   0.06    -0.01  -0.01   0.01    -0.04  -0.01   0.09
   4   6    -0.11  -0.02  -0.01    -0.08  -0.03  -0.03    -0.02  -0.01   0.04
   5   1     0.02  -0.24   0.26    -0.16  -0.33  -0.58     0.03   0.03   0.16
   6   1     0.46  -0.21  -0.18     0.17   0.20   0.32     0.10  -0.04  -0.07
   7   1     0.09   0.21   0.03     0.01  -0.16  -0.24     0.11   0.00   0.00
   8   1    -0.31   0.16   0.30     0.00  -0.14  -0.20    -0.06  -0.27  -0.36
   9   1    -0.08  -0.34   0.16    -0.17   0.23  -0.11     0.20   0.48   0.00
  10   1    -0.23   0.02   0.01    -0.17  -0.04  -0.09    -0.19  -0.17  -0.31
  11   1    -0.05   0.06  -0.11    -0.01   0.07   0.03    -0.03  -0.01  -0.22
  12   1    -0.05  -0.08   0.01    -0.14   0.04  -0.06     0.39   0.28   0.03
                     7                      8                      9
                     A                      A                      A
Frequencies --   857.4895               949.9951               991.1691
Red. masses --     1.9582                 1.3317                 1.2131
Frc consts  --     0.8483                 0.7081                 0.7021
IR Inten    --     2.2449                45.7621                 1.7501
Raman Activ --     5.7014                 2.9820                 0.3115
Depolar (P) --     0.1011                 0.7480                 0.7436
Depolar (U) --     0.1836                 0.8558                 0.8529
Dip. str.   --    10.4442               192.1729                 7.0442
Rot. str.   --     1.9074                 0.5579                -7.7826
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   6    -0.10   0.04   0.01     0.05   0.08   0.14    -0.05   0.07  -0.02
   2   6    -0.09   0.12  -0.02    -0.01  -0.02  -0.04     0.00  -0.02   0.01
   3   6     0.05  -0.16  -0.04     0.00   0.00   0.00     0.04  -0.02   0.04
   4   6     0.14  -0.01   0.05     0.00   0.00   0.00    -0.05   0.03  -0.05
   5   1    -0.35  -0.28   0.19    -0.20  -0.31  -0.53    -0.29  -0.23   0.29
   6   1     0.28  -0.03  -0.03    -0.23  -0.36  -0.60     0.40  -0.07  -0.15
   7   1    -0.03   0.09  -0.07    -0.02  -0.03  -0.05     0.34  -0.10  -0.11
   8   1    -0.09  -0.18  -0.13     0.00   0.00   0.00     0.44  -0.09   0.04
   9   1     0.02  -0.11  -0.06     0.04   0.00   0.01    -0.02   0.11  -0.01
  10   1    -0.25   0.01  -0.07     0.00  -0.01  -0.01     0.24   0.06   0.13
  11   1     0.43   0.42   0.23    -0.01  -0.01  -0.02    -0.22  -0.23  -0.03
  12   1    -0.09   0.15  -0.04     0.03   0.01   0.01    -0.06  -0.18   0.01
                    10                     11                     12
                     A                      A                      A
Frequencies --  1019.0447              1034.8243              1095.7551
Red. masses --     2.1105                 1.2017                 1.6888
Frc consts  --     1.2913                 0.7582                 1.1947
IR Inten    --     2.6376                10.2833                 4.2834
Raman Activ --     6.2342                 0.9423                 5.1019
Depolar (P) --     0.4923                 0.4254                 0.2144
Depolar (U) --     0.6598                 0.5969                 0.3532
Dip. str.   --    10.3256                39.6437                15.5950
Rot. str.   --    -6.5624                15.9803                -8.6996
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   6    -0.05   0.00   0.03    -0.01  -0.01  -0.01     0.03   0.01   0.01
   2   6    -0.04   0.05  -0.04     0.02   0.06   0.06    -0.03  -0.07  -0.08
   3   6     0.23   0.06   0.02     0.06   0.03   0.03     0.00   0.11   0.14
   4   6    -0.13  -0.12  -0.04    -0.03  -0.06  -0.02     0.05  -0.10  -0.08
   5   1    -0.13  -0.11  -0.13     0.13   0.21   0.32     0.05   0.04   0.03
   6   1    -0.03   0.11   0.21    -0.17  -0.20  -0.33     0.02  -0.01  -0.03
   7   1    -0.13   0.29   0.35    -0.31  -0.34  -0.61     0.16   0.08   0.19
   8   1     0.13   0.13   0.10     0.05   0.05   0.04     0.08  -0.03  -0.08
   9   1     0.55  -0.12   0.16     0.04   0.05   0.02    -0.39   0.32  -0.03
  10   1    -0.29  -0.19  -0.21    -0.16  -0.05  -0.06    -0.24   0.07   0.10
  11   1    -0.07  -0.02  -0.14     0.05   0.06   0.02     0.28   0.26   0.31
  12   1    -0.03   0.02  -0.06    -0.10   0.00  -0.05    -0.49  -0.12  -0.17
                    13                     14                     15
                     A                      A                      A
Frequencies --  1201.4542              1292.2905              1323.7390
Red. masses --     1.9183                 1.1715                 1.2593
Frc consts  --     1.6315                 1.1527                 1.3001
IR Inten    --     0.3313                 0.1565                 0.9238
Raman Activ --     0.9939                 8.8889                20.6619
Depolar (P) --     0.7348                 0.4826                 0.2762
Depolar (U) --     0.8471                 0.6510                 0.4328
Dip. str.   --     1.1001                 0.4832                 2.7841
Rot. str.   --     2.8983                 2.0617                -7.3523
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   6     0.05  -0.07   0.02     0.03  -0.01   0.00    -0.03  -0.08   0.06
   2   6    -0.07   0.15  -0.06    -0.04   0.03  -0.03     0.00   0.08  -0.03
   3   6     0.01  -0.15   0.11     0.02  -0.01  -0.03    -0.04   0.02  -0.03
   4   6    -0.01   0.06  -0.08    -0.03  -0.03   0.08     0.01  -0.03   0.00
   5   1     0.23   0.17  -0.18     0.10   0.08  -0.07     0.01  -0.01  -0.01
   6   1    -0.31   0.03   0.09    -0.01   0.00   0.00    -0.38   0.01   0.15
   7   1    -0.31   0.20   0.00    -0.03   0.07   0.02     0.80  -0.09  -0.25
   8   1     0.31  -0.36  -0.15     0.62   0.02   0.19     0.16   0.06   0.08
   9   1     0.11   0.21   0.03    -0.59  -0.07  -0.17     0.22   0.00   0.04
  10   1     0.29   0.15   0.19    -0.10  -0.15  -0.15    -0.03   0.00   0.02
  11   1    -0.13  -0.14   0.11     0.03   0.06  -0.13     0.07   0.07   0.01
  12   1    -0.09  -0.24  -0.01     0.20   0.18   0.07    -0.02   0.06  -0.02
                    16                     17                     18
                     A                      A                      A
Frequencies --  1346.9082              1409.3805              1459.2277
Red. masses --     1.3933                 1.2179                 1.1797
Frc consts  --     1.4893                 1.4253                 1.4801
IR Inten    --     2.6083                 1.6808                 1.7680
Raman Activ --     1.9797                 1.5702                13.6743
Depolar (P) --     0.3933                 0.2485                 0.3362
Depolar (U) --     0.5646                 0.3981                 0.5032
Dip. str.   --     7.7256                 4.7577                 4.8336
Rot. str.   --    -0.6517                -0.3995                -5.9280
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   6    -0.03  -0.02   0.03     0.00   0.00   0.00    -0.03  -0.02   0.02
   2   6     0.02   0.02  -0.05     0.01   0.01  -0.01    -0.10   0.01   0.03
   3   6     0.16  -0.02   0.04    -0.01  -0.01   0.00     0.04   0.02   0.01
   4   6    -0.05   0.05   0.01     0.11   0.06   0.05     0.00   0.01   0.00
   5   1    -0.09  -0.08   0.13    -0.03  -0.04   0.03     0.35   0.43  -0.38
   6   1    -0.27   0.01   0.06    -0.07   0.02   0.03     0.54  -0.15  -0.12
   7   1     0.21   0.00  -0.08     0.00   0.02   0.00     0.27  -0.07  -0.07
   8   1    -0.57  -0.02  -0.19     0.04   0.01   0.04    -0.12  -0.09  -0.20
   9   1    -0.59  -0.03  -0.15    -0.01   0.02  -0.01     0.00  -0.22   0.06
  10   1     0.14  -0.03  -0.05    -0.45  -0.09  -0.36     0.00  -0.02  -0.06
  11   1    -0.13  -0.08  -0.07    -0.26  -0.44  -0.24    -0.03  -0.04  -0.03
  12   1     0.10  -0.08   0.06    -0.51  -0.22   0.00    -0.05  -0.07   0.01
                    19                     20                     21
                     A                      A                      A
Frequencies --  1483.2423              1497.8695              1506.7519
Red. masses --     1.0745                 1.0405                 1.0744
Frc consts  --     1.3927                 1.3755                 1.4371
IR Inten    --     3.7619                 6.1840                 5.8163
Raman Activ --     7.0156                 5.4644                 1.7062
Depolar (P) --     0.7436                 0.7179                 0.6977
Depolar (U) --     0.8529                 0.8358                 0.8219
Dip. str.   --    10.1181                16.4703                15.3996
Rot. str.   --     3.1599                 0.8833                 4.7648
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   6    -0.01  -0.01   0.01     0.00   0.00   0.00     0.01   0.01  -0.01
   2   6    -0.02   0.00   0.00     0.00   0.00   0.00     0.01  -0.01   0.00
   3   6     0.01  -0.06  -0.02    -0.01   0.00   0.02    -0.03   0.05   0.01
   4   6    -0.02   0.02   0.00    -0.01  -0.01   0.05    -0.02   0.04   0.00
   5   1     0.08   0.09  -0.09    -0.01  -0.02   0.02    -0.05  -0.07   0.06
   6   1     0.13  -0.03  -0.02    -0.02   0.01   0.00    -0.08   0.02   0.01
   7   1     0.05   0.00   0.01    -0.03   0.00   0.01    -0.02  -0.01   0.00
   8   1    -0.17   0.31   0.50    -0.01  -0.05  -0.06     0.14  -0.12  -0.21
   9   1     0.07   0.58  -0.18     0.03  -0.03   0.04     0.03  -0.26   0.11
  10   1     0.13  -0.16  -0.22     0.49  -0.15  -0.04     0.14  -0.29  -0.46
  11   1     0.08   0.14   0.05     0.17   0.28  -0.62     0.15   0.25   0.23
  12   1     0.01  -0.28   0.08    -0.46   0.10  -0.09     0.10  -0.57   0.18
                    22                     23                     24
                     A                      A                      A
Frequencies --  1703.7024              3002.8390              3025.1467
Red. masses --     4.5279                 1.0652                 1.0346
Frc consts  --     7.7434                 5.6592                 5.5786
IR Inten    --    15.2021                24.0478                30.6375
Raman Activ --    53.5447               151.7344               175.2051
Depolar (P) --     0.0717                 0.1244                 0.0054
Depolar (U) --     0.1338                 0.2212                 0.0107
Dip. str.   --    35.5972                31.9485                40.4031
Rot. str.   --     1.6454                 3.2420                 5.1446
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   6     0.32   0.08  -0.17     0.00   0.00   0.00     0.00   0.00   0.00
   2   6    -0.38  -0.04   0.17     0.00   0.00   0.00     0.00   0.00   0.00
   3   6     0.06  -0.01  -0.02    -0.01   0.04   0.06     0.00   0.00   0.00
   4   6     0.01   0.00   0.00     0.00   0.00  -0.01    -0.04  -0.03  -0.01
   5   1     0.01  -0.39   0.22     0.01  -0.01   0.00     0.00   0.00   0.00
   6   1    -0.41   0.30  -0.02     0.00   0.01  -0.01     0.00   0.00   0.00
   7   1     0.35  -0.23   0.01     0.00  -0.01   0.01     0.00  -0.01   0.01
   8   1    -0.17   0.05   0.01    -0.06  -0.29   0.20    -0.01  -0.02   0.01
   9   1     0.12  -0.04   0.02     0.22  -0.24  -0.87    -0.01   0.01   0.02
  10   1    -0.02   0.01   0.00     0.00   0.00   0.00     0.10   0.53  -0.33
  11   1    -0.01  -0.03  -0.01    -0.05   0.03   0.00     0.45  -0.32  -0.02
  12   1    -0.03   0.00  -0.01    -0.01   0.02   0.07    -0.11   0.12   0.51
                    25                     26                     27
                     A                      A                      A
Frequencies --  3045.8428              3085.2985              3091.7298
Red. masses --     1.0950                 1.1012                 1.1026
Frc consts  --     5.9850                 6.1759                 6.2098
IR Inten    --     8.5547                34.5543                32.4623
Raman Activ --    99.4536                52.0201                63.1165
Depolar (P) --     0.6304                 0.5091                 0.7015
Depolar (U) --     0.7733                 0.6747                 0.8246
Dip. str.   --    11.2048                44.6800                41.8876
Rot. str.   --    -3.5777                 2.5718                -6.0845
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   6     0.00   0.00   0.00     0.00   0.00   0.00     0.00   0.00   0.00
   2   6     0.00   0.01   0.00     0.00  -0.01   0.00     0.00   0.00   0.00
   3   6    -0.02  -0.05   0.06     0.00   0.02  -0.02     0.00   0.00  -0.01
   4   6     0.00   0.01  -0.02    -0.02   0.07  -0.05     0.05  -0.03  -0.07
   5   1    -0.01   0.01   0.00     0.01  -0.01   0.00     0.00   0.00   0.00
   6   1     0.00  -0.01   0.01     0.00   0.01   0.00     0.00   0.00   0.00
   7   1    -0.01  -0.10   0.06     0.01   0.09  -0.06     0.00   0.05  -0.03
   8   1     0.14   0.75  -0.46    -0.04  -0.20   0.12    -0.01  -0.06   0.04
   9   1     0.07  -0.10  -0.29    -0.02   0.02   0.07    -0.03   0.04   0.12
  10   1    -0.03  -0.16   0.10    -0.13  -0.60   0.37    -0.01  -0.13   0.06
  11   1     0.08  -0.05  -0.01     0.48  -0.31  -0.03    -0.49   0.34   0.01
  12   1    -0.04   0.05   0.18    -0.06   0.08   0.25    -0.14   0.18   0.73
                    28                     29                     30
                     A                      A                      A
Frequencies --  3111.8117              3127.4730              3207.8890
Red. masses --     1.0838                 1.0649                 1.1151
Frc consts  --     6.1834                 6.1366                 6.7606
IR Inten    --    28.5204                 4.9746                16.4921
Raman Activ --    51.4556               150.3088                74.1719
Depolar (P) --     0.4156                 0.1063                 0.6080
Depolar (U) --     0.5872                 0.1922                 0.7562
Dip. str.   --    36.5636                 6.3455                20.5099
Rot. str.   --    -1.1632                 0.6819                -1.8943
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   6    -0.01   0.00   0.00    -0.05  -0.03   0.04    -0.05   0.08  -0.03
   2   6    -0.01  -0.07   0.04     0.01   0.02  -0.01     0.00   0.01  -0.01
   3   6     0.00  -0.01   0.01     0.00   0.00   0.00     0.00   0.00   0.00
   4   6     0.00   0.00   0.01     0.00   0.00   0.00     0.00   0.00   0.00
   5   1     0.18  -0.14   0.01     0.45  -0.34   0.04     0.64  -0.47   0.04
   6   1     0.01   0.10  -0.06     0.06   0.67  -0.42    -0.06  -0.49   0.32
   7   1     0.04   0.81  -0.49    -0.01  -0.18   0.11    -0.01  -0.10   0.06
   8   1     0.02   0.11  -0.07     0.00   0.00   0.00     0.00  -0.01   0.01
   9   1     0.02  -0.02  -0.06    -0.01   0.01   0.02     0.00   0.00   0.01
  10   1     0.02   0.07  -0.04     0.00  -0.01   0.00     0.00   0.00   0.00
  11   1    -0.01   0.01   0.00     0.00   0.00   0.00     0.00   0.00   0.00
  12   1     0.01  -0.01  -0.04     0.00   0.00   0.00     0.00   0.00   0.00

-------------------
- Thermochemistry -
-------------------
Temperature   298.150 Kelvin.  Pressure   1.00000 Atm.
Atom  1 has atomic number  6 and mass  12.00000
Atom  2 has atomic number  6 and mass  12.00000
Atom  3 has atomic number  6 and mass  12.00000
Atom  4 has atomic number  6 and mass  12.00000
Atom  5 has atomic number  1 and mass   1.00783
Atom  6 has atomic number  1 and mass   1.00783
Atom  7 has atomic number  1 and mass   1.00783
Atom  8 has atomic number  1 and mass   1.00783
Atom  9 has atomic number  1 and mass   1.00783
Atom 10 has atomic number  1 and mass   1.00783
Atom 11 has atomic number  1 and mass   1.00783
Atom 12 has atomic number  1 and mass   1.00783
Molecular mass:    56.06260 amu.
Principal axes and moments of inertia in atomic units:
                           1         2         3
     EIGENVALUES --    78.71526 435.78996 446.23933
           X            0.99999   0.00106  -0.00412
           Y           -0.00211   0.96419  -0.26519
           Z            0.00369   0.26519   0.96419
This molecule is an asymmetric top.
Rotational symmetry number  1.
Rotational temperatures (Kelvin)      1.10034     0.19875     0.19410
Rotational constants (GHZ):          22.92746     4.14131     4.04433
Zero-point vibrational energy     283580.5 (Joules/Mol)
                                   67.77737 (Kcal/Mol)
Warning -- explicit consideration of   4 degrees of freedom as
           vibrations may cause significant error
Vibrational temperatures:    155.27   329.56   455.21   624.23   942.54
          (Kelvin)           1147.81  1233.73  1366.83  1426.07  1466.18
                             1488.88  1576.55  1728.62  1859.32  1904.56
                             1937.90  2027.78  2099.50  2134.05  2155.10
                             2167.88  2451.24  4320.41  4352.51  4382.28
                             4439.05  4448.30  4477.20  4499.73  4615.43

Zero-point correction=                           0.108010 (Hartree/Particle)
Thermal correction to Energy=                    0.113283
Thermal correction to Enthalpy=                  0.114228
Thermal correction to Gibbs Free Energy=         0.080507
Sum of electronic and zero-point Energies=           -157.177728
Sum of electronic and thermal Energies=              -157.172455
Sum of electronic and thermal Enthalpies=            -157.171511
Sum of electronic and thermal Free Energies=         -157.205231
赞一下 回复此楼
8楼2013-12-09 09:38:59
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

marson

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-12-02 19:38:09
些小: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2013-12-03 15:17:32
--------------------------------------------------------------------------------------
# freq=(noraman,readisotopes) ub3lyp/6-31++G(d,p) opt

Title Card Required

1 2
O                  4.53438900   -2.22112600    0.11517600
H                  0.00000000    0.00000000    0.00000000

298.15,1.0
16
  2
----------------------------------

温度和压强应该按照上面的那种格式来输入，如果还是不正确的话你换做笛卡尔坐标试试~
赞一下 回复此楼
思想有多远，我们就能走多远~
2楼2013-12-02 18:14:18
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gkf高: 金币+5 2013-12-03 10:25:40
些小: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2013-12-03 15:18:37
1、readisotopes不是不可以用，但是属于已被废弃，不建议使用。如果你依然喜欢用，还是可以用的，包括你算同位素效应，用法不变。
2、新的使用方法（其实已经不新了），除了温度、压强新增了关键字，对于同位素则更简单，就是在你写坐标的时候，在相应的元素名称后面写上(iso=n)即可，举例而言：

#p hf/3-21g freq

title

0 1
O(iso=17) 0.0 0.0 0.0
H 1.0 0.0 0.0
H(iso=2) 0.0 0.0 1.0

==========
iso后面可以接两种格式的数据，如果是实数，则严格按照你输入的数据执行，比如，你写(iso=17.000)，那么计算的时候O同位素就采用17.000，如果你写的是整数，比如上面的例子，那么O同位素采用的是实际相应的精确同位素质量17O(16.99913)，2H(2.01410), 同时你没有特别说明的那个H，则自动采用1H的精确质量(1.00783)，我这么解释，你清楚了没？
赞一下 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
3楼2013-12-03 09:17:28
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

些小

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by marson at 2013-12-02 18:14:18
--------------------------------------------------------------------------------------
# freq=(noraman,readisotopes) ub3lyp/6-31++G(d,p) opt

Title Card Required

1 2
O                  4.5343 ...

谢谢你的解答，很清楚。
我按照你的方法重新建立了输入文件。果然不报错了。但是计算结果出来，和没有定义同位素是一样的。我想计算H和D的不同IR谱图，我看文献，说freq结果是有区别的，但是我算出来是 一样的。请问你知道是怎么回事吗？？？
谢谢！
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2013-12-06 19:23:45
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭