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upc穆宁

新虫 (小有名气)


[交流] 分配力场

大神们好:
      我建了一个体系,我想给体系中的金属原子分配compass力场,给其他院子分配cvff力场,请问要怎样实现呢?
(主要是cvff力场中没有金属原子的参数)
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Voland

金虫 (小有名气)


★ ★
upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-02 09:24:29
……唔,我用UFF和Dreiding玩过类似的事情,首先你得看懂力场文件,然后再在一个新建的力场文件中,按照所给的参数进行分配并自己写出一个新的力场文件。但是呢,你说用CVFF和COMPASS我就不清楚了,毕竟COMPASS的力场文件打开是乱码,想看懂都没可能。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

19楼2013-12-01 16:08:08
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hanhan1020

木虫 (正式写手)



月只蓝: 金币+1, 值得讨论。 2013-12-01 13:44:47
一个体系中还没见过 用不同力场的  这样的话 优化怎么办?
5楼2013-12-01 11:23:00
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sf127710627

铜虫 (初入文坛)


★ ★ ★ ★
upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+1, 值得讨论。 2013-12-06 10:51:07
upc穆宁: 金币+2 2013-12-06 11:38:06
?????e?????????
??discover?e?????f
???????????????compass?????o?x????
??setup?e???energy?_???????compass????
Automation?e?????????e???conditionally??no??no
Typing?e???????????conditionally??no
???????????x?????????????????assign
??????N??????????
?@????e????????????
29楼2013-12-06 01:45:18
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Voland

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
34楼: Originally posted by upc穆宁 at 2014-05-15 22:36:41
你好,请问你做分子模拟是用MS吗?...

……哇,半年前的帖子被挖出来了。是啊,当时是用MS做的分子模拟,有什么能帮得上忙的吗?
35楼2014-05-16 09:29:25
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hanhan1020

木虫 (正式写手)



upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
都用compass 不可以?
4楼2013-12-01 11:22:20
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upc穆宁

新虫 (小有名气)


引用回帖:
5楼: Originally posted by hanhan1020 at 2013-12-01 11:23:00
一个体系中还没见过 用不同力场的  这样的话 优化怎么办?

是吧
8楼2013-12-01 11:24:58
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hanhan1020

木虫 (正式写手)


没事  慢慢研究呗
9楼2013-12-01 11:25:43
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lastpython

木虫 (职业作家)



upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
Good luck
13楼2013-12-01 12:17:11
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heibi

金虫 (文坛精英)



upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
祝福楼主
14楼2013-12-01 12:18:11
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★ ★
upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-02 15:07:29
19L估计可行,compass的参数可以在lammps的class2找
21楼2013-12-02 13:47:38
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shenchunhua1980

金虫 (著名写手)



upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
21楼: Originally posted by pigrass at 2013-12-02 13:47:38
19L估计可行,compass的参数可以在lammps的class2找

楼主不厚道吧?这里说19楼估计可行,结果下面就没了19楼的回复,谁删除的呢?
22楼2013-12-03 08:50:06
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upc穆宁

新虫 (小有名气)


引用回帖:
22楼: Originally posted by shenchunhua1980 at 2013-12-03 08:50:06
楼主不厚道吧?这里说19楼估计可行,结果下面就没了19楼的回复,谁删除的呢?...

不是我,我还没看到呢,谁是19楼呀
23楼2013-12-03 09:28:09
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upc穆宁

新虫 (小有名气)


引用回帖:
22楼: Originally posted by shenchunhua1980 at 2013-12-03 08:50:06
楼主不厚道吧?这里说19楼估计可行,结果下面就没了19楼的回复,谁删除的呢?...

看到了,没删,19楼在
24楼2013-12-03 09:29:28
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upc穆宁

新虫 (小有名气)


引用回帖:
19楼: Originally posted by Voland at 2013-12-01 16:08:08
……唔,我用UFF和Dreiding玩过类似的事情,首先你得看懂力场文件,然后再在一个新建的力场文件中,按照所给的参数进行分配并自己写出一个新的力场文件。但是呢,你说用CVFF和COMPASS我就不清楚了,毕竟COMPASS的力 ...

高人呀,我是达不到水平了,我已经弃疗了
25楼2013-12-03 09:30:52
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引用回帖:
22楼: Originally posted by shenchunhua1980 at 2013-12-03 08:50:06
楼主不厚道吧?这里说19楼估计可行,结果下面就没了19楼的回复,谁删除的呢?...

就在回复的最上面啊
26楼2013-12-03 10:14:46
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Voland

金虫 (小有名气)


引用回帖:
25楼: Originally posted by upc穆宁 at 2013-12-03 09:30:52
高人呀,我是达不到水平了,我已经弃疗了...

不高人……我是一只研一的菜鸟而已,修改力场是必须的呀,而且UFF力场和Dreiding力场的相性那么好,不这么玩融合会让它们寂寞的。
但是最关键的是,你得看懂力场。这个倒也不是很难,比Gaussian的log文件字数少多了。
27楼2013-12-03 15:47:37
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upc穆宁

新虫 (小有名气)


引用回帖:
27楼: Originally posted by Voland at 2013-12-03 15:47:37
不高人……我是一只研一的菜鸟而已,修改力场是必须的呀,而且UFF力场和Dreiding力场的相性那么好,不这么玩融合会让它们寂寞的。
但是最关键的是,你得看懂力场。这个倒也不是很难,比Gaussian的log文件字数少多 ...

我是白手起家,专业也不在此,基础不如你雄厚呀
28楼2013-12-04 10:06:29
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upc穆宁

新虫 (小有名气)


???????:
29?: Originally posted by sf127710627 at 2013-12-06 01:45:18
?????e?????????
??discover?e?????f
???????????????compass?????o?x????
??setup?e???energy?_???????compass????
Automation?e?????????e???conditionally??no??no
Typing?e???????????c ...

???????????????????????????????????????????????????????????
30楼2013-12-06 11:37:46
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sf127710627

铜虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
30楼: Originally posted by upc穆宁 at 2013-12-06 11:37:46
恩,我也曾经这样想过。但是我没有找到相应的教程,大神可不可以给我推荐一下...

因為我好像也是在這邊爬板找到的,但忘記在哪一篇了。
所以我就把方法打出?斫o你看,你可以先嘗試看看,我找找看那篇文章
31楼2013-12-06 12:18:20
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sf127710627

铜虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
30楼: Originally posted by upc穆宁 at 2013-12-06 11:37:46
恩,我也曾经这样想过。但是我没有找到相应的教程,大神可不可以给我推荐一下...

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5228729&fpage=4
我在這篇裡面看到的,你可以研究看看
32楼2013-12-06 12:32:36
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upc穆宁

新虫 (小有名气)


引用回帖:
32楼: Originally posted by sf127710627 at 2013-12-06 12:32:36
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5228729&fpage=4
我在這篇裡面看到的,你可以研究看看...

ok,谢谢啦
33楼2013-12-06 16:41:00
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upc穆宁

新虫 (小有名气)


送红花一朵
引用回帖:
19楼: Originally posted by Voland at 2013-12-01 16:08:08
……唔,我用UFF和Dreiding玩过类似的事情,首先你得看懂力场文件,然后再在一个新建的力场文件中,按照所给的参数进行分配并自己写出一个新的力场文件。但是呢,你说用CVFF和COMPASS我就不清楚了,毕竟COMPASS的力 ...

你好,请问你做分子模拟是用MS吗?
34楼2014-05-15 22:36:41
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bokzhu

新虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也在找解决办法
36楼2020-07-12 21:32:49
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简单回复
2013-12-01 10:50   回复  
upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
[ 发自小木虫客户端 ]
bbeerrss3楼
2013-12-01 11:10   回复  
upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
祝福
yaoyao1456楼
2013-12-01 11:24   回复  
upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
wlxiao7楼
2013-12-01 11:24   回复  
upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
haixiawu10楼
2013-12-01 11:30   回复  
upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
2013-12-01 12:02   回复  
upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
2013-12-01 12:11   回复  
upc穆宁(金币+1): 谢谢参与
gyfwon15楼
2013-12-01 12:24   回复  
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wander051516楼
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readytogo17楼
2013-12-01 12:27   回复  
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huachao9018楼
2013-12-01 14:57   回复  
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hanhan102020楼
2013-12-02 12:58   回复  
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