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acdmail1

金虫 (小有名气)

[求助] gaussian计算中,如何使用二氧六环做为溶剂

gaussian计算,涉及使用二氧六环为溶剂,但g09中没有这个溶剂,需要自己添加,跪求二氧六环的溶剂半径、溶剂密度以及介电常数这三个参数。
多谢!
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何飘同学

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
acdmail1: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-01 10:15:48
1、4-二氧杂环己烷又称二恶烷,无色液体。稍有香味。密度1.0329,折射率1.4175。
介电常数可以查兰氏手册,溶剂半径则是用高斯基于优化好的结构,加入关键词:volume, 找到:
Recommended a0 for SCRF calculation =  3.91 angstrom (  7.39 bohr)
取3.91,单位为埃.
2楼2013-11-30 09:39:41
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acdmail1

金虫 (小有名气)

请问一下,这几个参数写入gjf文件的格式,能给个范例吗?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2013-12-01 10:17:15
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何飘同学

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
acdmail1: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 太感谢了! 2013-12-03 22:41:18
引用回帖:
3楼: Originally posted by acdmail1 at 2013-12-01 10:17:15
请问一下,这几个参数写入gjf文件的格式,能给个范例吗?

以甲醇作溶剂,求水分子的溶剂化能为例,如下为输入文件:
%chk=H2O-ch3oh-1.chk
%mem=1GB
%nprocshared=4
#p b3lyp/6-31g(d)  SCRF(PCM,read,Solvent=Generic,ExternalIteration,DoVacuum,SMD)

water,solvation by methanol, re-fined as generic solvent.

0 1
O                  0.00000000    0.00000000    0.11972000
H                  0.00000000    0.76156000   -0.47887900
H                  0.00000000   -0.76156000   -0.47887900

eps=32.63                   (静态介电常数,查手册)
epsinf=1.758                (动态介电常数,约等于折射率的平方)
RSolv=3.05                   (溶剂半径,用关键字 volume 求得)
Numeraldensity=0.7914  (溶剂密度)
(空一行)               结束
4楼2013-12-02 08:12:00
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