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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 甲苯中苯环面外振动的势能扫描
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

[求助] 甲苯中苯环面外振动的势能扫描

最近碰到个难题，需要借助论坛大神的力量！
课题需要关注甲苯的一种耦合振动：甲基旋转的同时苯环扭曲。
想做一个此种振型的势能曲线，刚性扫描
甲基旋转很好做，最大的问题是苯环的扭曲振动如何实现，我的想法是将某个C的二面角作为变量，但尝试了一周没有非常满意的结果，要么是一侧动一侧不动，要么就是整个苯环一起转。
不知是否有大神做过类似研究可提供下思路？或推荐几篇文献？
万谢~~
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1楼 2013-11-29 08:22:58
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virtualzx

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
5楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-11-29 00:51:19
甲基的旋转很好解决，苯环的振型比较复杂，并不是简单的几何问题那么容易改的。手动一个一个改是最后没有办法的办法，虽然单个计算量不大，但是总体就是几百个了，如果要求精度的话，因我还要观察甲基和苯环独立振 ...

我做苯酚，定义了内坐标之后沿着每个自由度分别做一系列线性位移。比较麻烦的是移动一个内坐标的时候要保持其他内坐标都恒定不变，这在自由度多的时候很难解析实现。我们的做法是先计算出wilson B matrix，然后就可以通过内坐标内的位移迭代解出笛卡尔坐标下的位移。
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15楼2013-11-30 04:52:41
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smthnb

禁虫 (正式写手)
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-11-29 15:24:57
本帖内容被屏蔽
2楼2013-11-29 13:04:52
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by smthnb at 2013-11-29 13:04:52
既然是刚性扫描，各个原子坐标的位置都是自己给定的，

你就手工输入各个原子的坐标不就完了？

可能没太明白你的问题…… 你具体解释解释什么叫 甲基旋转的同时苯环扭曲吧

假设苯环所在平面为A面，甲基3个H所在平面为B面，当苯环在A面上做面外振动时（即非拉伸振动），甲基的C旋转，3个H始终处于B面内。这个振型在的频率100~200cm-1之间

我已经手动算过此振型下分子坐标分别移动0.25,0.5,0.75,1的单点能。现在只是想把间隔缩小到0.1以内，手动输入会很耗时，所以想做扫描
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3楼2013-11-29 13:28:22
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smthnb

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
枪下游魂: 金币+50, ★有帮助, +5 2013-11-29 13:51:55
zhou2009: 金币-45, LZ实欲发+5，误为50，代扣回。 2013-11-29 16:55:31
枪下游魂: 金币+5, ★有帮助 2013-11-29 18:04:11
本帖内容被屏蔽
4楼2013-11-29 13:35:19
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