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手把手教你使用Materials Explorer
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Materials Explorer ： 立足于windows平台的多功能分子动力学软件系统， 拥有强大的分子动力学计算及Monte Carlo软件包， 是结合应用领域来学习材料工程的有力工具。 详细介绍见： http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=667427&fpage=2 特点: 包含了所有分子动力学引擎 可用于超大型物质系统 处理绝大多数材料，包括金属和无机物在内 的体系 灵活多变的仿真能力 并行计算，效率高 使用简单 下面是一个实例教程，手把手的教会你用~~ 免费的：http://www.isload.com.cn/store/t ... plorer.rar/downlaod 收费的见附件： [ Last edited by woshilsh on 2009-6-13 at 22:59 ] |
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 晶体模型计算分析 | 分子动力学 |
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http://www.hongcam.com.cn/html/software/materials_explorer.htm
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zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
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强大的多功能分子动力学软件系统 Materials Explorer——多功能分子动力学软件包。拥有强大的分子动力学计算及Monte Carlo软件包，是结合应用领域研究材料工程的有力工具。她的计算速度非常快，单机即可模拟几千原子在内的体系。ME带有便捷友好的图形界面，同时适合专业用户和实验用户。 功能: 模块能力： 1. Crystal Builder 用于无机固体及分子晶体系统的研究； 2. Solution Modeler 轻松建立随机多组分液相或气相系统； 3. Layer Cell Model 研究异相系统（气-固界面，固体颗粒边界等）； 4. 可导入由CAChe或WinMOPAC建造的分子结构； 5. 轻松进行分子模拟，从而研究晶体或外延生长，表面吸附和表面破坏； 6. 利用复制，剪切和粘贴功能建立带有缺陷和杂质的模块系统； 7. 利用自选的客户-服务模量可在vector或SMP Unix服务器上进行高性能计算； 8. 时间-依赖的温度和压力控制用于研究相转变和模拟退火。 科学能力 1．各种灵活的模拟功能： 利用Parrinello-Rahman-Nose法进行NEV,NTV,NPH,NTP模拟； 利用SHAKE和MATRIX算法进行键约束计算周期边界条件； 联合原子模型； 2．评估界面势能的高级算法大大提高了计算效率。 3．外部电场的应用。 分析能力 Materials Explorer可评估以下性质： 1. 对X射线和中子衍射的干涉函数； 2. 电子配对相关性和自由基分布函数； 3. 方均位移核扩散常数； 4. 利用Voronoi分析对无定形固态进行表征； 5. Monitoring Module 用来显示时间与温度，压力，内部能量等性质的二维图像； 6. 3D Atomic Configuration Module用来显示系统的快照，轨迹和动画； 7. MSD Module 从输出数据计算方均位移（MSD），并可显示其二维图像。还可计算每个元素的扩散,系数以及每个分子的重心； 8. PCF Module计算配对相关性函数和自由基分布函数，并会出相应的二维图； 9. 研究体系包括有机物、高聚物、生物大分子、金属、陶瓷材料、半导体等晶体、非晶体、液体和气体相变、膨胀、压缩系数、抗张强度、缺陷等。 新版本增加了聚合物建模功能及热传导率分析功能。聚合物建模功能可轻松制作原来制作难度较大的聚合物聚集体模型。热传导率分析功能采用非平衡分子动力学方法，能够以更高的精度算出热传导率.图形功能的强化则以两种套件为对象。加强了多光源设定、材料特性显示、图像单元显示等可进行高效描述的图形功能。 |
6楼2007-12-22 14:13:20
3楼2007-12-22 12:04:52
4楼2007-12-22 12:05:58
5楼2007-12-22 14:08:27
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csfn(金币+1,VIP+0):me软件我没具体用，但是评价“很差劲”我觉得不当，稍微了解了下今年prl也有用他的，而且我用了下感觉建模简单而且有独特优势，计算以及分析模块也简单好用
yyx19840628(金币+0,VIP+0):我想问你一下MS的建模怎么建，cubic cell with edge sizes of 33A,还有我找不到MS怎样模拟退火过程
csfn(金币+1,VIP+0):me软件我没具体用，但是评价“很差劲”我觉得不当，稍微了解了下今年prl也有用他的，而且我用了下感觉建模简单而且有独特优势，计算以及分析模块也简单好用
yyx19840628(金币+0,VIP+0):我想问你一下MS的建模怎么建，cubic cell with edge sizes of 33A,还有我找不到MS怎样模拟退火过程
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在我看来，materials explorer很差劲。先说建模吧，建一个简单的模型感觉都挺复杂的，而且好多文件格式无法导入。与MS建模的方便、快捷相比，它简直就是。。。。。。 再说力场吧，分子动力学模拟的关键在于力场，一个好的力场参数是成功描述一个体系首要条件，materials explorer里用的好像都是amber之类的力场，与MS里的discover力场没法比，建了同样一个体系，用discover运行结果挺好，用materials explorer跑起来就全散架了。所以在我个人看来，materials explorer跟MS里的建模模块和分子动力学模块相比，难以望其项背。 VASP是基于第一性原理的分子动力学模拟（ab-initio MD），而materials explorer是经典分子动力学模拟，两者完全不一样，没什么可比性。 唯一让我觉得它不错的地方就是可以非常方便的加入电场、力场。但是MS里也可以加入电场(只是要在它的输入文件里加而已)，所以优势并不明显。 这只是我个人使用的一点感受而已，因为materials explorer使用的不多，所以评价可能并不完全，甚至有不当之处，请见谅。 [ Last edited by szukkboy1 on 2007-12-23 at 15:05 ] |
7楼2007-12-23 14:59:27
8楼2007-12-25 01:38:04
9楼2008-01-07 01:26:43
10楼2008-01-08 13:19:27
11楼2008-03-02 18:56:06
12楼2008-03-14 09:07:38
13楼2008-04-09 15:12:02
14楼2008-04-10 11:49:16
15楼2008-12-13 23:33:19
16楼2008-12-14 17:52:46
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spur2楼
2007-12-21 22:56
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