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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 求助如何添加原子！！
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
9楼: Originally posted by zhywind200 at 2013-12-12 09:27:29
我常识优化一下构型 无论是加对称性还是不加  都是直接job failed...

还有优化用什么模块什么参数
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
11楼2013-12-12 10:05:51
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zhywind200

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by pigrass at 2013-12-12 10:05:51
还有优化用什么模块什么参数...

恩 谢谢！
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  • 附件 1 : 1981.cif
    • 2013-12-19 16:09:03, 2.39 K
12楼2013-12-19 16:09:11
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

引用回帖:
12楼: Originally posted by zhywind200 at 2013-12-19 16:09:11
恩 谢谢！...

自己打开cif学学
cif里标记了那种原子是需要加氢的

loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_symmetry_multiplicity
_atom_site_Wyckoff_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_occupancy
_atom_site_attached_hydrogens
_atom_site_B_iso_or_equiv

O5 O2- 4 a 0 0 0.690(8) 1. 2 1.25(6)

找出O5的位置
右键select symmetry images
右键display style 修改原子颜色好做标记
build——symmetry——make P1
选择刚才标记的原子，adjust hydrogen

求助如何添加原子！！
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13楼2013-12-20 10:24:21
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zhywind200: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2013-12-27 16:06:37
引用回帖:
12楼: Originally posted by zhywind200 at 2013-12-19 16:09:11
恩 谢谢！...

关于结构优化
我用的forcite
不过有12个原子需要手动指定
不能完全自动分配力场

求助如何添加原子！！-1
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14楼2013-12-20 13:38:25
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zhywind200

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by pigrass at 2013-12-20 13:38:25
关于结构优化
我用的forcite
不过有12个原子需要手动指定
不能完全自动分配力场

...

这几天再改文章，等过几天好好研究研究  关于手动指定这个  不太会  等过几天  我先尝试着看看如果手动指定  谢谢你
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15楼2013-12-27 16:15:12
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