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yx007yx007

新虫 (小有名气)

[求助] 高斯如何计算在纯醋酸溶液中反应的自由能变化呢?

最近做了一个化学反应是在纯醋酸(液态)中用反应物A 和B 与醋酸分子共同反应产生一系列产物。 醋酸在这里既是溶剂也是反应物之一。

产物的成分都已经做了分析。

用高斯对各种物质的气相结构都做了优化。

问题是怎么计算在纯醋酸的体系下溶质分子的吉布斯自由能再计算反应自由能变化呢?

简单的把醋酸当作一般溶剂处理可以么?

比如像这里建议的,输入如下参数就可以么还是有特殊的处理方法?

"wolfzhong (站内联系TA)
可以,IEFPCM就合适离子型溶液,具体见help。
给个直接的例子:
SCRF=(IEFPCM,Read,Solvent=DMSO) SCF=tight  (这里DMSO和我想模拟的离子溶液接近)
SCFVAC (真空中用HF方法)
IONIC(Performs a PCM calculation for ionic solution according to the IEF-PCM formalism.)
RADII=UAHF (radii optimized for the HF/6-31G(d) level of theory )
TSARE=0.3 (Set the average area of the tesserae generated on each sphere in the cavity surface)
TABS=353 (绝对温度 K)
TSNUM=240 (每个分子表面的划分成多少小块)
EPS=13 (介电常数)
DENSITY=0.003883 (溶液密度)
VMOL=154.37  (溶剂的摩尔体积)
RSOLV=2.83  (溶剂分子的半径)
DISM=6.45 (离子强度,根据体系设定)"

谢谢!
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marson

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yx007yx007: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-11-22 04:35:51
以醋酸为溶剂吧,重新定义一个溶剂模型:
可以按照如下方式定义:
scrf=(pcm,solvent=generic,read)
在文件结尾给出
SolventName= acetate                 这个你可以随便起一个名字
EpsInf=X                       这个是频率依赖的介电常数,数值是折射率的平方。
Eps=X                                                         这个是介电常数
Gaussian公司官方的Clemente博士说:“重新定义溶剂,如果是基态计算,只需要Eps,如果是激发态计算,两个都需要”。
思想有多远,我们就能走多远~
2楼2013-11-21 09:30:14
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yx007yx007

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by marson at 2013-11-21 09:30:14
以醋酸为溶剂吧,重新定义一个溶剂模型:
可以按照如下方式定义:
scrf=(pcm,solvent=generic,read)
在文件结尾给出
SolventName= acetate                 这个你可以随便起一个名字
EpsInf=X                ...

谢谢!
高斯里有预设acetic aicd。
准备用B3LYP来优化溶液里的结构并计算自由能。
3楼2013-11-22 04:34:48
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ts63

铜虫 (正式写手)

2011

朋友,您有高斯的教程么?新手做这个液相均相催化的溶剂效应,其中也有冰醋酸,头疼中……
小硕一枚!
4楼2013-12-06 22:55:08
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