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rainandstar

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
我爱开组会: 金币+9, ★★★★★最佳答案, 大神! 谢谢 2013-11-19 13:38:42
xinmor: 博学EPI+1, 欢迎应助 2013-11-30 08:22:46
楼主,你好,可以翻译成去卷积(仪器公司的工程师一般也这么说),意思就是你说的【3】。我来详细解释一下。

1,分子量为M的蛋白质在电喷雾条件下一般是带多电荷的,比[M+7H]7+,[M+8H]8+...[M+12H]12+,等;

2,那么这个时候就有一个问题,蛋白质的分子量M到底是多少?这个时候就需要去卷积了,根据具体的多电荷的质谱峰对应的m/z的值,就可以反推回M的值(数学过程是解二元一次方程组的过程,具体推导过程可以找本书看一下,很简单);

3,针对你实际贴出来的这个图,fig (a)与你的问题没有任何关系。fig (b)是电喷雾实际得到的结果,请注意:legends里专门说了同一个蛋白质有两组峰,即 more “native-like” (○) ,表示更接近蛋白变性程度相对较轻,也就是说带的电荷更少;and a more unfolded (●) conformation,表示蛋白变性程度更多,这种情况下蛋白带的电荷会更多。使用上述任何一组数据都可以通过去卷积过程得到蛋白质的分子量,也就是fig (c)的情况。

4,换一种说法,fig (c)不是电喷雾直接得到的数据,而是通过程序的数学计算之后得到的结果。

5,实际上在电喷雾发展的早期(90年代),去卷积功能都是人工算的;无非是后来技术成熟了,就内嵌到程序里了。

6,建议楼主仔细看下这两个方向:(1)MS based proteomics;(2)application of ESI,(3)仪器的说明书(不要小看他);书和综述都很多。Mann在2003年前后的nature或者science上有个很基础的综述,引用次数应该接近3000次了,推荐你看一下,按照(1)的关键词就可以找到。
3楼2013-11-18 23:51:13
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