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rainandstar

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
我爱开组会: 金币+9, ★★★★★最佳答案, 大神！ 谢谢 2013-11-19 13:38:42
xinmor: 博学EPI+1, 欢迎应助 2013-11-30 08:22:46
楼主，你好，可以翻译成去卷积（仪器公司的工程师一般也这么说），意思就是你说的【3】。我来详细解释一下。

1，分子量为M的蛋白质在电喷雾条件下一般是带多电荷的，比[M+7H]7+，[M+8H]8+...[M+12H]12+，等；

2，那么这个时候就有一个问题，蛋白质的分子量M到底是多少?这个时候就需要去卷积了，根据具体的多电荷的质谱峰对应的m/z的值，就可以反推回M的值（数学过程是解二元一次方程组的过程，具体推导过程可以找本书看一下，很简单）；

3，针对你实际贴出来的这个图，fig （a）与你的问题没有任何关系。fig （b）是电喷雾实际得到的结果，请注意：legends里专门说了同一个蛋白质有两组峰，即 more “native-like” (○) ，表示更接近蛋白变性程度相对较轻，也就是说带的电荷更少；and a more unfolded (●) conformation，表示蛋白变性程度更多，这种情况下蛋白带的电荷会更多。使用上述任何一组数据都可以通过去卷积过程得到蛋白质的分子量，也就是fig （c）的情况。

4，换一种说法，fig （c）不是电喷雾直接得到的数据，而是通过程序的数学计算之后得到的结果。

5，实际上在电喷雾发展的早期（90年代），去卷积功能都是人工算的；无非是后来技术成熟了，就内嵌到程序里了。

6，建议楼主仔细看下这两个方向：（1）MS based proteomics；（2）application of ESI，（3）仪器的说明书（不要小看他）；书和综述都很多。Mann在2003年前后的nature或者science上有个很基础的综述，引用次数应该接近3000次了，推荐你看一下，按照（1）的关键词就可以找到。
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3楼2013-11-18 23:51:13
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