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xulong712711

铜虫 (初入文坛)

[求助] shRNA设计

本人是新手,现在设计shRNA,怎么看到有些设计的序列中为U,有些为T?我用life网站设计出的shRNA,怎么用BLUST比对?是直接把shRNA目标DNA输进去比对?一般为19还是21nt?
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xulong712711

铜虫 (初入文坛)

自己顶一下
2楼2013-11-17 11:00:04
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-17 22:30:26
我只知道shRNA的结尾是oligoT 作为RNA polymerase III的终止信号
序列其他地方的T 还真不知道干什么的

推荐一个文献Design and cloning strategies for constructing shRNA expression vectors
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/ ... 552/?tool=pmcentrez
3楼2013-11-17 16:30:34
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