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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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xiaoyong1983

木虫 (小有名气)

[求助] 序列嵌合体检查

请教坛子里的各位经验高手,环境样品中微生物群落分析过程中,提取总细菌的DNA,测序后,如何判断序列是否嵌合体呀?请大家知无不言,言无不尽,谢谢大家了!
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科研呀科研
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cz200717

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
xiaoyong1983: 金币+5, ★★★很有帮助, 这个我知道,觉得不太好用,但是谢谢你 2013-11-18 19:01:29
xuweimbf: 金币+1, 积极应助。 2013-11-19 08:07:32
2楼2013-11-18 16:06:20
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cz200717

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

内容已删除
3楼2013-11-18 20:13:52
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xiaoyong1983

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by cz200717 at 2013-11-18 20:13:52
mothur软件什么的也可以,只是复杂一点,这个网站的方便…………...

请教个问题哈,这网站上辨别的嵌合体并不一定都是嵌合体,也就是说可能把正常的序列也认为是嵌合体,这种如何区分呀?
科研呀科研
4楼2013-11-18 21:55:04
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cz200717

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by xiaoyong1983 at 2013-11-18 21:55:04
请教个问题哈,这网站上辨别的嵌合体并不一定都是嵌合体,也就是说可能把正常的序列也认为是嵌合体,这种如何区分呀?...

的确有这个问题,后来我用软件,还是有这个问题。反正我后来就是把可能的嵌合体序列Blast,如果相似度很低的话就确认是嵌合体……感觉这些软件都不太靠谱,不知道有没有好点的检测软件。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2013-11-18 23:34:21
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匿名

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6楼2014-06-05 10:54:57
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