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yuehedou木虫 (小有名气)
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[求助]
求教几个microRNA前体的概念：biased error和biased bulge等的意思
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| 这几天看关于使用高通量测序分析植物miRNA的文献，看到一部分使用mFold预测miRNA前体的软件设置，几个名词看不懂了，希望哪位高手赐教一二。原文处是：no more than 8 nucleotides and 4 biased errors in one bulge and no more than 2 biased bulges and 6 errors in mature region of the predicted hairpin. 其中的biased error， biased bulge和mature region的概念不太懂，求赐教！最好还能把这句话给翻译下。。。 |
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Davidzjy
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【答案】应助回帖
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mature region很好理解 前体就是不成熟的miRNA 成熟的就是最终留下的那几十个bp的RNA片段 bulge代表dsRNA中的某一条链会多出一个或多个不能配对的碱基 导致在这一侧形成一个突起（另一边不会） error我想应该是因为两侧碱基无法配对而导致internal loop的情况吧 下面这个图很形象的给出了RNA的各种二级结构： www.nature.com/nrm/journal/v5/n12/fig_tab/nrm1528_F1.html |
2楼2013-11-11 13:04:30
yuehedou
木虫 (小有名气)
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3楼2013-11-11 15:16:34