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清泉一边

新虫 (初入文坛)

[求助] MEME作图提示 one or more zero-length sequences 怎么回事 已有1人参与

MEME提示 The sequences submitted for the input dataset appear to contain one or more zero-length sequences.
Please check to be sure that your data is formatted properly.
There was 1 error on the form. Please correct it and try again.s怎么回事?fasta格式的文件。
所用序列为氨基酸序列。
另外MEGA5.0做进化树也做不出来。我用的序列是一基因家族氨基酸序列,相似度应该很高。但所下载的氨基酸序列有个别很短。
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天涯自在飞

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
137167741: 金币+1, 小木虫交流,共同进步~~ 2014-01-23 19:57:22
这个主要是你提交的fasta文件中存在空白的ORF文件所致,简单来说就是>ORF#¥¥¥%后面没有具体的氨基酸序列,所以这个程序报错,把这样的ORF找到后删除掉就可以了。
2楼2014-01-23 18:21:25
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18758884755

新虫 (初入文坛)

我现在遇到了同样的问题,一个家族的做树做不出来
如鱼得水
3楼2017-03-03 09:38:43
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