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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » bader分析的chgsum.pl在vasp中找不到
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蘑菇爱科研

银虫 (初入文坛)

[求助] bader分析的chgsum.pl在vasp中找不到 已有1人参与

各位大神：
用bader分析的时候得到AECCAR0和AECCAR2两个文件，我要把他们两个相加，在BADER CHARGE ANALYSIS那个网站上下的chgsum.pl
的脚本，直接考到vasp下，和AECCER0和AECCER2在同一个目录下，执行chmod，
然后chgsum.pl AECCER0 AECCER2
结果显示  chgdum.pl: command not found
有人遇到和我相同的问题么？为什么找不到chgsum.pl呢？是不是我不能把它直接考过来？之前还要进行什么编译的工作吗?和我VASP的
脚本有关系吗？
求不吝赐教！！
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1楼 2013-11-07 10:37:32
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snow119c

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

网上下来的chgsum.pl文件 运行时要加perl，即

perl chgsum。pl AECCAR0 AECCAR2

运行bader时要把编译好的可执行bader放到／bin文件夹里去 因为那里面都是可执行文件

如果并行就要用

mpirun －np 核数 bader CHGCAR -ref CHGCAR_sum
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13楼2014-07-09 23:56:33
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xiaoluoj

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
identation: 金币+1, 谢谢交流 2013-11-07 13:24:17
首先chmod +x chgsum.pl
然后./chgsum.pl  AECCER0 AECCER2
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2013-11-07 11:23:02
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zuocuiping

木虫 (职业作家)
bader 文件执行不了
怎么办呢？
谢谢
bader CHGCAR -ref CHGCAR_sum
出现错误
-bash: /home/Or1982/bin/bader: cannot execute binary file
赞一下 回复此楼
3楼2013-11-08 20:05:26
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sxm2012

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zuocuiping at 2013-11-08 20:05:26
bader 文件执行不了
怎么办呢？
谢谢
bader CHGCAR -ref CHGCAR_sum
出现错误
-bash: /home/Or1982/bin/bader: cannot execute binary file

是不是没有bader文件啊，我的也找不到，都不能用！
赞一下 回复此楼
4楼2014-02-25 18:31:20
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