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goalry

金虫 (正式写手)

[交流] 大家是怎么建立层状模型的?【完毕】

现在用于分子动力学的软件很多,我主要用的是XMD,搞的是金属界面扩散,还在学习中。。。

很想听听大家现在在用什么软件,研究的方向是什么?

在你们的软件中,你是怎么建立层状模型的?

[ Last edited by goalry on 2009-3-23 at 20:11 ]
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君子以自强不息,厚德载物
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元小雪

木虫 (职业作家)

再说了,软件只是工具而己,用哪个软件不重要,重要的是我们的模型是否恰当,还要尽量对模型从数学上进行简化,减少运算量
无聊的博士
4楼2007-12-13 15:01:44
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y1ding

铁杆木虫 (著名写手)


goalry(金币+1,VIP+0):不知道你是怎么码的
建立层状模型的,我觉得就是手工一个个码上去。
2楼2007-12-13 09:08:35
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元小雪

木虫 (职业作家)

★ ★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,希望继续关注计算模拟版
goalry(金币+1,VIP+0):
我觉得NAMD和GROMACS要好一些,里面有好多有用的工具包,建立模型也简单得多.至于建立层次的方法还不好说,得看具体的问题吧,我有时候是按能量来做的.其它的方法只是自己觉得可行,没有理论依据.先看一些相关的文献资料,别人如果用那种方法得到了正确结果,就可以类似的做,这样保险一些
无聊的博士
3楼2007-12-13 14:59:47
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

MS里面建各种复杂晶格都很方便的 建界面自己编程也可以 旋转一个合适的角度就是了
5楼2007-12-14 11:52:05
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