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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » RNA提取结果，帮忙分析下原因
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fangliu0823

金虫 (小有名气)
★
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genome DNA 污染，现在的试剂盒都有去除基因组这一步骤，建议试一下！提的RNA效果是完整的
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自己强大靠自己
11楼2013-11-05 10:48:59
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沙门小rna

金虫 (正式写手)
★
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5楼: Originally posted by quanquan1101 at 2013-11-05 09:27:41
基因组污染是什么原因引起的？...

各种原因。就算是外星人也不能完全去除的。用dna酶消化
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应助之星就是我~没错。你没有看错~
12楼2013-11-05 11:03:21
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赵?骺佳�

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我用的TAKALA的RNAISOPLUS提的 效果还可以 你可以试一试 我提的是全血的样本（冻存）
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13楼2013-11-05 11:06:37
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zgb1982

木虫 (正式写手)
难道是RNA seq
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14楼2013-11-05 11:09:36
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不喝咖啡

新虫 (初入文坛)
★
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感觉用于测序的话质量稍差，有降解，上面应该是基因组DNA，消化一下重新沉淀就没事了
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15楼2013-11-06 15:59:22
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幻影望晴

新虫 (初入文坛)
★
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你的这个肯定是有基因组污染了，先用DNase处理一下，在进行反转录，得到的目的条带如果是单一条带可以直接把PCR产物送测序，但是如果有非特异性条带存在就要进行胶回收再连接T载体，得到的菌液再测序
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16楼2013-11-06 16:13:41
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quanquan1101

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by vege的桌子 at 2013-11-05 09:47:12
是基因组污染，你是用什么提的？

trizol 试剂
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17楼2013-11-09 19:27:02
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quanquan1101

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by yelangfh713 at 2013-11-05 10:02:40
很明显是genome DNA混入了，不知道你这个是什么RNA，一般我们提微生物RNA之后都是再用DNase 1把DNA去除，再反转录成cDNA，至于测序，不明白为什么用RNA测序

表达谱测序，是在mRNA水平进行测序
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18楼2013-11-09 19:27:53
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quanquan1101

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 郭瑞坚001 at 2013-11-05 02:56:36
应该是dna

有方法去除吗？
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19楼2013-11-09 19:29:52
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quanquan1101

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by laojiu9878 at 2013-11-05 08:20:26
dna

有方法去除吗？
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20楼2013-11-09 19:30:10
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