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绍敏郡主

木虫 (著名写手)


[交流] 请问虚频问题

优化得到一个结构,有一个-11的虚频。
请问如何能将虚频去掉?
这个虚频对应于金属原子的左右摆动。

[ Last edited by 绍敏郡主 on 2013-11-4 at 22:34 ]
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virtualzx

木虫 (著名写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
绍敏郡主: 金币+5, 谢谢指导 2013-11-05 23:56:56
gkf高: 金币+3 2013-11-06 21:35:23
引用回帖:
12楼: Originally posted by 绍敏郡主 at 2013-11-04 22:05:51
谢谢。
我这样做了以后确实就没有虚频了。
在计算频率之前,优化已经收敛了,4个都是yes,但是频率计算完以后,又变成前两个yes后两个no,请问这是怎么回事。后两个与收敛标准差的很远。...

之前优化是用猜测的二阶导数,所以步长小。你有一个很浅的势能面,曲率很小,而一个方向上的步长基本上等于导数除以曲率,所以计算正确的曲率后步长变大了。你可以读入算出的频率重新优化;这么小的频率建议加上opt=tight和int=ultrafine选项。

如果曲率太小,步长太大可能会出现震荡的情况,出现这种情况建议你沿着这个振动模式的方向先扫描一个一维势能曲线,然后从这曲线上的最低点开始搜索。
17楼2013-11-05 23:16:44
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枪下游魂

木虫 (著名写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
绍敏郡主(金币+1): 谢谢参与
gmy1990: 金币+1 2013-11-04 21:58:14
绍敏郡主: 金币+5 2013-11-05 10:46:49
将分子向按虚频坐标移动一点再优化
2楼2013-11-04 12:46:23
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绍敏郡主

木虫 (著名写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-11-04 12:46:23
将分子向按虚频坐标移动一点再优化

谢谢
6楼2013-11-04 13:05:34
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marson

银虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★
绍敏郡主(金币+1): 谢谢参与
绍敏郡主: 金币+5 2013-11-05 10:46:59
将虚频对应的坐标提取出来乘以系数0.2,然后与优化后的坐标相加,作为初始坐标,重新优化~可消虚频,原理与将分子构型向虚频方向移动一点一样~
11楼2013-11-05 10:37:45
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