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Tandem repeats finder 如何使用？
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各位虫友，有没有人能帮我详解一下这个的参数设置的意义和结果分析？ Alignment Parameters (match, mismatch, indels) 这都代表啥？如何设置？ Minimum Alignment Score To Report Repeat 这都代表啥？如何设置？ Maximum Period Size 这都代表啥？如何设置？ 结果中： Found at i:13192 original size:24 final size:26 Alignment explanation Indices: 13138--13195 Score: 70 Period size: 24 Copynumber: 2.4 Consensus size: 26 这3个代表啥意思？ 13128 TATTACTAAT * * 13138 AATTAA-AAATTAAATAAAAAATTTT 1 AATTAATAAACTAAATAAAAAATTTA 13163 AA-TAATAAACTAAAT-AAAAA-TTA 1 AATTAATAAACTAAATAAAAAATTTA 13186 AATTAATAAA 1 AATTAATAAA 13196 AATTAAAAAT 该如何分析？ |
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