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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 药物化学 » 分子对接
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lsan90

木虫 (正式写手)

[求助] 分子对接

用分子对接技术预测化合物的药理作用，哪位虫友知道分子对接技术需要哪些软件及数据库吗，急用！谢啦！
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生活永不止步~
1楼 2013-10-29 23:31:12
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踏径

木虫 (小有名气)
听起来很高级~不好意思楼主仅是抱着学习的心态进来的。。。
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走走停停再走
2楼2013-10-30 15:58:48
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luckboylys

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lsan90: 金币+5, ★有帮助, 就药效作用 2013-11-01 22:05:13
xiaoxiao270: 金币+1, 谢谢交流 2013-11-02 12:05:30
不知道你所说的药理作用是什么意思！！
分子对接的软件有商业版和免费版；
商业版有MOE，DS，薛定谔等，这些都是软件集合，内嵌对接模块
免费版有autodock等，
数据库？？取决于你做什么吧！
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前途一片迷茫，但心却已定向
3楼2013-10-31 10:08:27
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autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lsan90: 金币+5, ★有帮助 2013-11-01 22:24:41
xiaoxiao270: 金币+1, 谢谢交流 2013-11-02 12:05:38
首先确定靶点蛋白，一般从pdb数据库上可以下载
确定配体，自己合成或者天然提取活性成分
对接软件很多了
免费的Autodock
收费的DS，DOCK，sybyl等等
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4楼2013-10-31 20:20:07
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lsan90

木虫 (正式写手)
内容已删除
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生活永不止步~
5楼2013-11-01 22:24:02
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wang369

木虫 (职业作家)
★
xiaoxiao270: 金币+1, 谢谢交流 2013-11-02 12:05:48
首先你要确定你预测小分子是针对什么靶点，靶点蛋白的三维结构是否已获得，你得小分子是采用那种标准判断其活性！先自己看些基本概念和别人做的案例吧！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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6楼2013-11-01 23:44:33
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luckboylys

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lsan90 at 2013-11-01 22:24:02
请问，确定靶点蛋白是什么意思，分子对接完全不懂的，想预测一下青蒿酸的药效作用...

你的意思是你完全不知道青蒿酸的药理作用，或者说作用靶点？
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前途一片迷茫，但心却已定向
7楼2013-11-02 17:44:04
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lsan90

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by luckboylys at 2013-11-02 17:44:04
你的意思是你完全不知道青蒿酸的药理作用，或者说作用靶点？...

可以这么说吧，所以想先预测一下在此基础上做验证
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生活永不止步~
8楼2013-11-02 22:55:09
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