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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 恳请帮忙介绍研究多个基因家族可以采用的既省时又高效的方法
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daiti

铁虫 (小有名气)

[求助] 恳请帮忙介绍研究多个基因家族可以采用的既省时又高效的方法

大家好！ 现在我遇到的情况是这样的：从公布的基因组测序数据中检索出了我感兴趣的3个基因家族共计约80个成员的基因全长及cDNA全长，想研究下这些家族成员在我的材料中的表达情况（6份材料，6个发育时期），请问：
1、我还需要去做RACE，找出每个家族成员在我所用的材料中全长么？
2、用从基因组测序数据中检索出的cDNA序列直接设计qPCR引物，去检测在我的试材中的定量表达情况，这个思路是否是正确的？
3、若第2项是正确的，那80个成员×6个发育时期×6份材料×3个重复，将是一个庞大的数字，而且后续的试验还要设计多个处理进去，做qPCR的工作量简直是太恐怖了。这种情况是否可以用基因芯片的方法来做呢？
4、像我这样对于已知基因家族的表达研究，是否还有其它的方法可以做到高效检测呢？

    我是一个分子生物学的入门新手，对于里面的世界还很迷茫，恳请各位大神不吝赐教，给我指导，拜谢！
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1楼 2013-10-28 17:52:08
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daiti

铁虫 (小有名气)
求关注！！
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2楼2013-10-29 07:56:59
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deguohan

至尊木虫 (职业作家)

教授、博/硕导

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
daiti: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-10-30 21:42:18
如果你要克隆基因的属  和公布的基因组测序的材料的属相同，可以直接设计两头引物作PCR，不用做RACE，否则就只能作为参考。另外基因芯片应该可以减少不少工作量，你可以和公司细谈具体方法。
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天道酬勤，厚德载物
3楼2013-10-30 16:46:40
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daiti

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by deguohan at 2013-10-30 16:46:40
如果你要克隆基因的属  和公布的基因组测序的材料的属相同，可以直接设计两头引物作PCR，不用做RACE，否则就只能作为参考。另外基因芯片应该可以减少不少工作量，你可以和公司细谈具体方法。

谢谢你！

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4楼2013-10-30 21:41:49
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