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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于mRNA颈环结构影响结合活性的问题
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woshihaokkk

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于mRNA颈环结构影响结合活性的问题

敢问各位研神，mRNA3'UTR区段的microRNA结合位点形成了颈环结构，这样是否会导致二者结合变弱，调控能力低下？我荧光素酶检测和定量结果差异很大，故此求助。万谢百拜。
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1楼 2013-10-23 22:40:28
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David勇

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-10-24 17:43:33
你确定是形成了颈环结构？如果是当然会有影响的。但是为什么不接到载体上就不会有颈环结构？荧光素酶检测室双转染的，好定量结果有差异是应该的，但是总体趋势是不变的啊。你荧光的内参校正没问题吧？
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2楼2013-10-24 09:41:42
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woshihaokkk

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by David勇 at 2013-10-24 09:41:42
你确定是形成了颈环结构？如果是当然会有影响的。但是为什么不接到载体上就不会有颈环结构？荧光素酶检测室双转染的，好定量结果有差异是应该的，但是总体趋势是不变的啊。你荧光的内参校正没问题吧？

通过软件预测看到的颈环结构，接到的载体是PSICHECK2，内参是和测定UTR在同一载体的，而且重复了3次以上了，都这样，我就猜到是颈环结构影响。至于为啥不接到载体上就不会有颈环影响，我真心不懂啊，所以特此求助。
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3楼2013-10-24 10:22:40
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David勇

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
woshihaokkk: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-11-07 16:07:17
引用回帖:
3楼: Originally posted by woshihaokkk at 2013-10-24 10:22:40
通过软件预测看到的颈环结构，接到的载体是PSICHECK2，内参是和测定UTR在同一载体的，而且重复了3次以上了，都这样，我就猜到是颈环结构影响。至于为啥不接到载体上就不会有颈环影响，我真心不懂啊，所以特此求助。...

miR和Psicheck2是同时转染还是先后。先转miR效果会明显点。
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4楼2013-10-24 16:36:34
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woshihaokkk

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by David勇 at 2013-10-24 16:36:34
miR和Psicheck2是同时转染还是先后。先转miR效果会明显点。...

做的共转。
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5楼2013-10-24 18:51:04
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David勇

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by woshihaokkk at 2013-10-24 18:51:04
做的共转。...

先转miR效果会比较明显。我试过。你可以试一下。顺便问下，你预测颈环结构是用什么软件的？
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6楼2013-10-24 21:14:16
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woshihaokkk

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by David勇 at 2013-10-24 21:14:16
先转miR效果会比较明显。我试过。你可以试一下。顺便问下，你预测颈环结构是用什么软件的？...

RNA structure，从网站搜很多人再用的。
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7楼2013-10-27 09:09:00
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沙门小rna

金虫 (正式写手)
来顶贴看大神解答。~涨姿势了~
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应助之星就是我~没错。你没有看错~
8楼2013-10-27 11:17:45
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