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nnfyw

木虫 (著名写手)

[求助] 基因片段分析

请教问题：通过构建文库获得插入基因片段，如何对这段基因序列进行分析，获得基因的ORF；核糖体结合位点，催化位点等信息，谢谢
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1楼 2007-12-07 16:25:01
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nnfyw

木虫 (著名写手)
dog_608582
你好，是cDNA文库，想筛选能产生淀粉酶的基因，通过选择性平板筛选出表达淀粉酶的菌落，测序列后，ORF可以由好多软件来确定，但是而核糖体结合位点，催化位点等信息很难确定，请详细指点，谢谢。
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4楼2007-12-08 20:41:23
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clocksoar

木虫 (正式写手)
可以用Vector NTI 软件分析就可以了
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2楼2007-12-08 16:44:30
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dog_608582

木虫 (正式写手)
★ ★
nnfyw(金币+2,VIP+0):xiexie
楼主应该说明建的是什么文库.当然从你的问题判断可能是cdna文库.通常用一般的DNA分析软件都可以分析出ORF.比如DNAMAN或Sequencher 3就可以分析.而核糖体结合位点，催化位点等信息首先要确定你的片段序列是什么.通常用BLAST比对就可以确定了.然后你再通过结构域去判核糖体结合位点，催化位点.如果你建的是DNA文库.就只能先比对.然后做分析.当然是比较麻烦的.我建议是先测序,BLAST比对后在分析.另外,楼主应该告诉更多的信息.那样才能给出更详细的建议
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3楼2007-12-08 19:49:44
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