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slshing

铁虫 (小有名气)

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[交流] 读《萃取微生物转化》一书的摘要和心得已有2人参与

读《萃取微生物转化》一书的摘要和心得
《萃取微生物转化》一书就生物催化剂的底物选择性做了如下论述：“一般的生物化学教科书对完成复杂生命过程的葡萄糖分解代谢都进行了详细的阐述。在自然界的进化过程中，生命体形成了经济的降解复杂化合物的代谢途径。生命体并非形成一套完整的新陈代谢途径来降解特定的有机化合物，而是由特定的酶来催化特定的复杂有机化合物以形成常规新陈代谢网络中的代谢中间体，代谢中间体进入常规代谢网络后，利用常规代谢途径进行进一步的新陈代谢……。另一种更为经济的新陈代谢方式是微生物群落中的不同微生物间通过‘接力’来完成复杂的有机化合物的降解，如反刍动物瘤胃中微生物群落降解木质纤维等。一个研究得比较清楚的例子是微生物群落降解莠去津。Alvey等采用富集培养的方法得到了能稳定降解除草剂莠去津的微生物群落，但其中的任何一种微生物的纯培养都不能降解莠去津。通过PCR技术测定了莠去津代谢基因在微生物群落中的分布，并通过进一步生物化学实验证实：这个微生物群落中至少包括Clavibacter sp.负责将莠去津代谢为N-乙基三聚氰酸二酰胺和Psedomonas CN完成N-乙基三聚氰酸二酰胺的进一步代谢。这样每一种微生物只需合成一种或很少几种酶，进一步降低了合成降解复杂化合物所需酶的能量消耗。
目前发现新的酶促反应主要是以选择性培养基为基础的微生物富集纯培养技术。由于微生物培养环境与自然界环境间存在巨大差异，纯培养技术很难获得有关丰富多彩的未培养微生物中的酶促反应信息。PCR技术可以获得微生物群落的相关基因信息，通过基因比对和克隆技术进一步将有关新的基因转化到宿主细胞后进行培养，这样可以筛选到全新的酶促反应。这一技术也称为‘分子筛选’。分子筛选是获得未培养微生物中有关新酶促反应信息的有力工具。通过上述可知，微生物应用技术越来越关注什么提到信息和生态系统信息，这些信息是那样的至关重要。又因为当前基因测序的主要工作是同源性基因比对和归类，而不具有同源性基因的酶也有可能催化某一化学反应，这样现实中许多丰富的信息在筛选过程中有可能被‘过滤’掉了。读《萃取微生物转化》一书的摘要和心得
《萃取微生物转化》一书就生物催化剂的底物选择性做了如下论述：“一般的生物化学教科书对完成复杂生命过程的葡萄糖分解代谢都进行了详细的阐述。在自然界的进化过程中，生命体形成了经济的降解复杂化合物的代谢途径。生命体并非形成一套完整的新陈代谢途径来降解特定的有机化合物，而是由特定的酶来催化特定的复杂有机化合物以形成常规新陈代谢网络中的代谢中间体，代谢中间体进入常规代谢网络后，利用常规代谢途径进行进一步的新陈代谢……。另一种更为经济的新陈代谢方式是微生物群落中的不同微生物间通过‘接力’来完成复杂的有机化合物的降解，如反刍动物瘤胃中微生物群落降解木质纤维等。一个研究得比较清楚的例子是微生物群落降解莠去津。Alvey等采用富集培养的方法得到了能稳定降解除草剂莠去津的微生物群落，但其中的任何一种微生物的纯培养都不能降解莠去津。通过PCR技术测定了莠去津代谢基因在微生物群落中的分布，并通过进一步生物化学实验证实：这个微生物群落中至少包括Clavibacter sp.负责将莠去津代谢为N-乙基三聚氰酸二酰胺和Psedomonas CN完成N-乙基三聚氰酸二酰胺的进一步代谢。这样每一种微生物只需合成一种或很少几种酶，进一步降低了合成降解复杂化合物所需酶的能量消耗。
目前发现新的酶促反应主要是以选择性培养基为基础的微生物富集纯培养技术。由于微生物培养环境与自然界环境间存在巨大差异，纯培养技术很难获得有关丰富多彩的未培养微生物中的酶促反应信息。PCR技术可以获得微生物群落的相关基因信息，通过基因比对和克隆技术进一步将有关新的基因转化到宿主细胞后进行培养，这样可以筛选到全新的酶促反应。这一技术也称为‘分子筛选’。分子筛选是获得未培养微生物中有关新酶促反应信息的有力工具。通过上述可知，微生物应用技术越来越关注什么提到信息和生态系统信息，这些信息是那样的至关重要。又因为当前基因测序的主要工作是同源性基因比对和归类，而不具有同源性基因的酶也有可能催化某一化学反应，这样现实中许多丰富的信息在筛选过程中有可能被‘过滤’掉了。因此‘分子筛选’或‘虚拟筛选’对发现新的酶促反应的影响非常有限。

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