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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 求助高斯频率计算
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xiaokeaini83

铜虫 (小有名气)

[交流] 求助高斯频率计算

我昨天对一对大分子结合物进行优化和频率计算
优化２个小时左右正常完成．而随后的频率计算一直停在
＂SE2nd: IAtom= ＂６个小时了还是一点也没往前计算，也没报错．
请高人指点下　谢谢！！！！
以下是我的输入文件
%Chk=leu4.chk
# RPM3 Opt(Tight) Pop=(Minimal,) Freq Test

leu4

1  1
N 0    0.238705    1.057216    1.253701
C 0    0.393908    1.656448    2.647222
C 0    1.875406    1.673107    2.986788
C 0   -0.399899    0.837302    3.674705
O 0    2.151600    2.449002    4.105546
O 0    2.727230    1.253476    2.233657
C 0   -0.036946   -0.654818    3.746116
C 0   -1.283257   -1.473939    4.046639
C 0    1.022169   -0.916121    4.804578
H 0   -0.354857    1.649230    0.706851
H 0   -0.191641    0.148097    1.347172
H 0    1.132015    0.968379    0.809481
H 0   -0.019878    2.704515    2.642453
H 0   -1.485015    0.958447    3.462107
H 0   -0.254235    1.306055    4.672520
H 0    3.131511    2.463368    4.259199
H 0    0.367518   -0.990352    2.753118
H 0   -1.014618   -2.536656    4.120689
H 0   -2.043539   -1.367098    3.261511
H 0   -1.743663   -1.174071    4.998172
H 0    1.291852   -1.981073    4.798437
H 0    0.660526   -0.663192    5.811251
H 0    1.932849   -0.330114    4.622618
C 0    5.606384   -1.695940   -0.907449
C 0    5.606649   -2.914791   -1.879725
C 0    4.153501   -3.370977   -2.158497
C 0    3.438506   -3.643094   -0.804818
C 0    3.550568   -2.405208    0.129604
C 0    3.059230   -2.720567    1.561354
O 0    6.283679   -2.515353   -3.053801
O 0    4.242598   -4.554716   -2.926602
O 0    2.043908   -3.814320   -1.061154
O 0    4.901159   -1.956738    0.274263
O 0    3.702310   -3.796190    2.183832
C 0    5.229229    3.330406   -2.605285
C 0    5.818471    2.308292   -3.621372
C 0    5.384073    0.867320   -3.261402
C 0    5.690372    0.569231   -1.766207
C 0    5.223362    1.710078   -0.819656
C 0    5.883160    1.590448    0.575352
O 0    5.379864    2.685324   -4.913700
O 0    6.116057    0.013033   -4.116193
O 0    4.916909   -0.587941   -1.439545
O 0    5.564518    3.018590   -1.285607
O 0    7.283471    1.601668    0.574031
C 0    0.497059    5.261500   -4.075003
C 0    1.149076    4.185073   -4.999530
C 0    2.080803    3.279971   -4.147566
C 0    3.119871    4.185448   -3.429031
C 0    2.418904    5.308198   -2.613824
C 0    3.432347    6.371804   -2.130912
O 0    0.184052    3.475149   -5.723970
O 0    2.657186    2.275054   -4.942678
O 0    3.822546    3.353143   -2.508054
O 0    1.444438    6.023514   -3.374993
O 0    4.156685    7.009238   -3.146820
C 0   -3.936277    4.825074   -1.179320
C 0   -3.956570    5.389787   -2.627922
C 0   -2.678780    4.964767   -3.400737
C 0   -1.406384    5.305477   -2.573455
C 0   -1.530189    4.783606   -1.112698
C 0   -0.428211    5.399643   -0.218192
O 0   -5.122497    5.050492   -3.327138
O 0   -2.568724    5.678079   -4.616165
O 0   -0.292565    4.590650   -3.112402
O 0   -2.764390    5.153145   -0.490282
O 0   -0.358618    4.823237    1.055244
C 0   -6.141931    0.149980    0.143889
C 0   -6.624581    0.798981   -1.187818
C 0   -5.539534    1.755132   -1.754771
C 0   -5.091332    2.762494   -0.658514
C 0   -4.685884    2.002638    0.636398
C 0   -4.465153    2.954440    1.842357
O 0   -3.110858    3.082462    2.166012
O 0   -7.031996   -0.138339   -2.147802
O 0   -6.052947    2.525916   -2.826489
O 0   -3.922033    3.411902   -1.154840
O 0   -5.721978    1.115801    1.068290
C 0   -3.252765   -4.251432    0.990353
C 0   -4.438866   -4.382882   -0.007306
C 0   -4.812209   -2.998774   -0.596906
C 0   -5.031470   -1.960807    0.539498
C 0   -3.863731   -1.981293    1.566651
C 0   -4.227362   -1.269871    2.893581
O 0   -4.197300   -5.329220   -1.013746
O 0   -6.020609   -3.053778   -1.329398
O 0   -5.020010   -0.676709   -0.093353
O 0   -3.469607   -3.295573    1.979946
O 0   -5.384128   -1.765088    3.507002
C 0    1.562651   -5.141603   -1.078128
C 0    0.348241   -5.228320   -2.049954
C 0   -0.782835   -4.304115   -1.532482
C 0   -1.144133   -4.734549   -0.083240
C 0    0.123965   -4.710865    0.814089
C 0   -0.123496   -5.347731    2.200862
O 0    0.809550   -4.865259   -3.331129
O 0   -1.917796   -4.472812   -2.369619
O 0   -2.061715   -3.759702    0.405674
O 0    1.206856   -5.457198    0.243758
O 0   -0.630872   -6.651523    2.149768
H 0    6.632926   -1.456917   -0.541648
H 0    6.185100   -3.745081   -1.402397
H 0    3.604649   -2.583669   -2.734127
H 0    3.880238   -4.541413   -0.295819
H 0    2.933067   -1.566459   -0.276162
H 0    1.959288   -2.904224    1.529893
H 0    3.248406   -1.879363    2.250985
H 0    6.248881   -3.252395   -3.651465
H 0    3.381470   -4.696752   -3.298671
H 0    3.704944   -4.518807    1.561761
H 0    5.667433    4.347178   -2.744833
H 0    6.933687    2.393628   -3.585235
H 0    4.290009    0.736386   -3.467883
H 0    6.791172    0.387388   -1.626214
H 0    4.114767    1.660053   -0.687198
H 0    5.516199    0.668675    1.070005
H 0    5.628202    2.450527    1.219475
H 0    5.795786    2.084104   -5.520227
H 0    5.995352   -0.881610   -3.795632
H 0    7.568653    0.991692   -0.101202
H 0   -0.050317    6.041023   -4.654137
H 0    1.719309    4.692779   -5.811251
H 0    1.483369    2.696636   -3.405961
H 0    3.808615    4.658437   -4.181910
H 0    1.904037    4.873778   -1.715355
H 0    4.136978    5.903845   -1.414562
H 0    2.927536    7.208738   -1.616906
H 0   -0.304689    2.943724   -5.106698
H 0    3.564054    2.519024   -5.136199
H 0    4.413952    6.337670   -3.773090
H 0   -4.736975    5.274648   -0.545234
H 0   -4.022706    6.502780   -2.581287
H 0   -2.707923    3.868872   -3.626235
H 0   -1.224890    6.408516   -2.575543
H 0   -1.449535    3.667335   -1.100462
H 0   -0.615207    6.466131   -0.000122
H 0    0.556352    5.318437   -0.732655
H 0   -5.266871    4.106478   -3.238056
H 0   -3.388701    5.562122   -5.078638
H 0   -0.180332    3.896991    0.944478
H 0   -6.967675   -0.371440    0.684457
H 0   -7.568653    1.361798   -0.994447
H 0   -4.661029    1.171055   -2.127830
H 0   -5.913528    3.491825   -0.445845
H 0   -3.757117    1.407814    0.445446
H 0   -4.899424    2.542261    2.773083
H 0   -4.931920    3.942906    1.661783
H 0   -2.703501    3.631647    1.505078
H 0   -6.356672   -0.803900   -2.216679
H 0   -6.463174    1.923499   -3.434322
H 0   -3.096416   -5.189367    1.575205
H 0   -5.312038   -4.825716    0.527923
H 0   -4.004959   -2.647752   -1.290245
H 0   -6.009557   -2.148140    1.053097
H 0   -2.971770   -1.470962    1.127720
H 0   -4.467279   -0.206302    2.711460
H 0   -3.368552   -1.306969    3.592867
H 0   -3.404769   -5.068792   -1.490376
H 0   -6.006241   -3.852734   -1.840974
H 0   -5.203459   -2.655402    3.781775
H 0    2.338274   -5.909215   -1.308854
H 0   -0.008139   -6.288970   -2.075586
H 0   -0.463120   -3.234644   -1.559192
H 0   -1.583424   -5.764868   -0.088238
H 0    0.476442   -3.654890    0.973656
H 0   -0.911912   -4.790469    2.738625
H 0    0.801750   -5.307386    2.809410
H 0    0.071284   -4.961048   -3.918592
H 0   -2.135565   -3.602320   -2.677022
H 0    0.045415   -7.208738    1.785493

[ Last edited by xiaokeaini83 on 2007-12-5 at 08:54 ]
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1楼 2007-12-05 08:53:35
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
★
vzhang77(金币+1,VIP+0):多谢热心应助！：）
频率计算要对每一个原子的三维坐标求力矩阵，体系太大，估计计算用时会很长。
赞一下(11人) 回复此楼
2楼2007-12-05 10:12:24
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xiaokeaini83

铜虫 (小有名气)

to yytsnake

很长是多长时间呢？３-５天可以算完吗？？
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3楼2007-12-05 10:41:00
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
★
vzhang77(金币+1,VIP+0):多谢热心应助！：）
也许3、5天，也许会更长一些，要看你的计算机配置如何了。我曾有一个分子算过半个月。
赞一下(11人) 回复此楼
4楼2007-12-05 22:46:51
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mscic

金虫 (正式写手)
★ ★
vzhang77(金币+2,VIP+0):多谢热心应助！：）
你的输入文件有问题

ＲＯＵＴＥ　ＳＥＣＴＩＯＮ　部分有问题

你之前已经做过优化，在计算频率的时候不需要再写ＯＰＴ，这样写等于再做了一遍优化．另外可以对ＦＲＥＱ加选项，比如加ＮＯＲＡＭＡＮ，可以减少一点计算时间．
赞一下(10人) 回复此楼
5楼2007-12-05 23:26:11
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xiaokeaini83

铜虫 (小有名气)

to mscic

ＦＲＥＱ＝ＮＯＲＡＭＡＮ　这么写吗？
还有　如果一天之内ＦＲＥＱ没算完　怎么再原来基础上进行呢？
我只知道　ＯＰＴ　是用ＯＰＴ＝ＲＥＳＴＡＲＴ　
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6楼2007-12-07 09:03:47
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
★
vzhang77(金币+1,VIP+0):多谢热心应助！：）
频率计算只能在优化的基础上从头算，不能从中断处接着算。
赞一下(10人) 回复此楼
7楼2007-12-07 12:43:52
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mscic

金虫 (正式写手)
★
vzhang77(金币+1,VIP+0):多谢热心应助！：）
还有　如果一天之内ＦＲＥＱ没算完　怎么再原来基础上进行呢？


你不关机器就行了，实验室应该不会停电的啦，嘎嘎
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8楼2007-12-07 13:49:07
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xiaokeaini83

铜虫 (小有名气)
我们实验室会停电的！！！
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9楼2008-01-17 11:11:18
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