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老汉聊变量选择
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俗话说，一个好汉三个帮。一个可靠的模型，一定是建立在可靠的变量的基础上的。没有好的变量，再简单的模型也不可靠。因此，虽然建模的方法丰富多样，评估的方法也各具特色，但是变量的选择却是实实在在的关键。 目前，QSAR/QSPR/QSTR/QSMR等（其实数学/计量学上都是一回事）的变量已经泛滥成灾，最多的可以弄出2千多个变量（描述子，Descriptor）来。 那么，如何选出可靠的变量呢？ 首先，要进行预处理。如标准化、中心化、正规化等。 此外，还要弄清楚，哪些是整型的，哪些是实数的。一般需要分开处理。 其次，对具有共线性的若干变量，只保留一个。 再次，删除对不敏感（也就是对很多样本来说都一样）的若干变量。 在这些步骤之后，可以做一个PCA（主成分分析），观察一下。 在因子载荷图上，变量是不是一簇一簇的？ 对于成一簇的，可以尽量选出“代表”，一般选位于簇心偏距原点较远的。 老汉是主张“多看”的。 现在，很多软件，包括Sybyl, Material Studio等，似乎非常自信，根本不给用户观察的机会，一闪，结果就出来了。老汉此时，总在心里说：“啊...呸”。 怎么有点像《奋斗》里的华子？ 佟大为--饰陆涛 朱雨辰--饰华子 徐翠翠--饰露露 周晓鸥--饰猪头 华子听说/看到猪头撬了自己的女友露露， 啊...呸 啊...呸 啊...呸 呸了陆涛好几脸。 |
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