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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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黑熊1990

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

[求助] 谁用过Interproscan啊?我有点问题想咨询一下

我想用147个DBD来筛选,我查看文献里的方法,包括三个东西,我的序列,147个DBD序列,interproscan软件及其数据库,他们的应用方法原文我剪切在下面的图片里,大体意思是“我的蛋白序列库要用interproscan软件去寻找含有DBD序列的数据”,我看了interproscan 5.0的使用方法,但是还是弄不懂这是怎么弄得,大家帮帮忙啊
谁用过Interproscan啊?我有点问题想咨询一下
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现在的目标:让心中的女神看得起自己……然后找个女朋友
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wizardfan

实习版主

优秀版主

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
137167741: 金币+1, 小木虫交流,共同进步~~ 2013-10-16 08:40:15
看上去像是用147个DBD序列来构建一个profile,然后用5个序列去match 这个profile。你看下HMMER这个软件,就可以理解profile的意思了,
2楼2013-10-16 06:17:05
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黑熊1990

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2013-10-16 06:17:05
看上去像是用147个DBD序列来构建一个profile,然后用5个序列去match 这个profile。你看下HMMER这个软件,就可以理解profile的意思了,

但是,我把这147个数据汇成了一个库,我也理解profile的意思,但是不知道怎么用interproscan去建这个profile啊,HMMER里的方法又不能用在interproscan里
现在的目标:让心中的女神看得起自己……然后找个女朋友
3楼2013-10-16 15:45:47
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