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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 谁用过Interproscan啊？我有点问题想咨询一下
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黑熊1990

铁虫 (小有名气)

[求助] 谁用过Interproscan啊？我有点问题想咨询一下

我想用147个DBD来筛选，我查看文献里的方法，包括三个东西，我的序列，147个DBD序列，interproscan软件及其数据库，他们的应用方法原文我剪切在下面的图片里，大体意思是“我的蛋白序列库要用interproscan软件去寻找含有DBD序列的数据”，我看了interproscan 5.0的使用方法，但是还是弄不懂这是怎么弄得，大家帮帮忙啊
谁用过Interproscan啊？我有点问题想咨询一下
cut.JPG
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1楼 2013-10-14 18:06:04
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
137167741: 金币+1, 小木虫交流，共同进步~~ 2013-10-16 08:40:15
看上去像是用147个DBD序列来构建一个profile，然后用5个序列去match 这个profile。你看下HMMER这个软件，就可以理解profile的意思了，
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2楼2013-10-16 06:17:05
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黑熊1990

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2013-10-16 06:17:05
看上去像是用147个DBD序列来构建一个profile，然后用5个序列去match 这个profile。你看下HMMER这个软件，就可以理解profile的意思了，

但是，我把这147个数据汇成了一个库，我也理解profile的意思，但是不知道怎么用interproscan去建这个profile啊，HMMER里的方法又不能用在interproscan里
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现在的目标：让心中的女神看得起自己……然后找个女朋友
3楼2013-10-16 15:45:47
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