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cometring

木虫 (著名写手)

爱你就等于爱自己

[交流] 【求助】关于MS画图建模的两个问题

1 MS的建立模型要以坐标为基础,比较规整的结构还好说,但是如果是比较复杂的结构,比如表面上吸附各种分子,那么吸附分子中的各个原子坐标确定就很麻烦,特别是有时候要精确的指定位置,这样只能通过几何计算吗?有没有更简单的软件,轻松把坐标算出来?

2 对于原子堆积的图用什么画比较好,我是指可以把它拿出来的那种, MS虽然作图功能不错,但是不知道文献上哪些是如何画出来的,好像不是用MS,请大家指点一下。用chemwin之类的?哪个软件比较好用?

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-25 at 19:05 ]
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csfn

荣誉版主 (知名作家)

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cometring(金币+20,VIP+0):牛人!!
spur(金币+2,VIP+0):正解!!!
1,复杂的结构也可以做的,可以参考下这个帖子:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=646969&fpage=1
表面上吸附分子,原子,首先参考下实验或已有理论建长,然后在ms上可以直接调节,比如用鼠标点击选中原子,然后按住鼠标的左键或者中间的滑轮就可以自由拖动了,按住shift的就可以固定xy方向z方向拖动了。简单的软件期待ing ^_^
2,文献上的图一般是可以用ms模拟出来的,我没大懂你的意思,ms做图功能是很强大的,应该这个是首选的。原子堆积应该是首选:-)
2楼2007-12-03 22:28:01
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yhjiangshiyu

木虫 (正式写手)

ms做图功能是很强大的,应该这个是首选的


也不一定,我看到有的文献上的图比MS的要好,做吸附的时候它直接给出了键长及吸附分子的原子种类,这个我觉得很直观,只是不清楚是用的什么软件。
另外MS的作图好像显示的同种原子大小相同,有时候难以区分立体,如果可以做类似投影模型的图的话好像也不错。
流星,虽然短暂,却迸发出最强的光芒,耀眼夺目。
3楼2007-12-04 09:02:22
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wanghongbo0808

银虫 (小有名气)

MS 也可以给出键长及吸附分子的原子种类阿
MS可以通过结构优化来自动调节结构的 我们只要画出大概的位置就行 当然不能太离谱 不符合实际就不行了
i don't care who you are where you're from what you did as long as you love MS群:50691921
4楼2007-12-04 10:18:59
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hew

木虫 (正式写手)

坐标可以通过谱图精修的方法确定
5楼2007-12-04 14:48:21
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搞理论的

银虫 (正式写手)

还有一个问题,怎么调节MS里面的单位设置啊?好像默认的是angstrom,能不能改成原子单位(a.u)啊?
6楼2007-12-05 14:49:15
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