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veradpp

木虫 (正式写手)

[交流] 请教:如何确定全局最低能量构象?

一般软件里面的geometry optimization确定的是局部能量最小,怎样才能够找到全局能量最小?全局能量最小构象的标志是什么?
如果一个构象的全部频率均大于0,能说这个构象是全局最优吗?

请高手多多指教,谢谢
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suntao1982

木虫 (著名写手)

小木虫


csfn(金币+1,VIP+0):3q,值得参考
是的,要看频率,过渡态要有一个虚频
做中国人的化学!!!!
2楼2007-12-03 22:30:56
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suny2005

木虫 (小有名气)


csfn(金币+1,VIP+0):3Q,欢迎常来
即使没有虚频也不一定是全局最小,很可能是局域最小
要想得到全局最小,应该进行势能面扫描
3楼2007-12-04 08:58:40
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veradpp

木虫 (正式写手)

再请教一下如何进行势能面扫描呢?
常用的软件有哪些,hyperchem 可以吗?
4楼2007-12-05 19:55:40
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spur

金虫 (正式写手)

Vasp、MS、Wien2K这几个软件好像都只能找到局域最小,期待高人指点什么软件可以进行势能面全扫描,找到全局最小!
5楼2007-12-05 20:49:56
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deadbook

银虫 (小有名气)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,希望继续关注计算模拟版
全局最小是一个世界难题,不是哪一个商业软件随便就可以解决的。现在比较流行的比如遗传算法,还有big-bond,还有高温模拟退火等等,都是计算全局最小的方法。
6楼2007-12-05 23:41:22
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ggdh

专家顾问 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,希望继续关注计算模拟版
用sybyl或者macromodel里面的conformation search
7楼2007-12-13 00:00:10
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

呵呵 即使遗传算法也不敢说他就找到了真正的全局最小 相互作用势的复杂程度和计算时间决定他是否能找到全局最小
8楼2007-12-14 12:03:43
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sandf

木虫 (正式写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版解答问题。
最小都只能说是个相对的量。如果看多了那些寻找簇合物能量最小构型的文献就会知道,总是会有后面的文章说自己的研究构型能量比前人研究的小。目前用得比较多的就是基因算法。
正如7楼所说的,这是世界难题
努力呀努力,不要成为奴隶。
9楼2007-12-14 12:32:50
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