24小时热门版块排行榜    

查看: 1279  |  回复: 9
当前主题已经存档。

veradpp

木虫 (正式写手)

[交流] 请教:如何确定全局最低能量构象?

一般软件里面的geometry optimization确定的是局部能量最小,怎样才能够找到全局能量最小?全局能量最小构象的标志是什么?
如果一个构象的全部频率均大于0,能说这个构象是全局最优吗?

请高手多多指教,谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

suntao1982

木虫 (著名写手)

小木虫


csfn(金币+1,VIP+0):3q,值得参考
是的,要看频率,过渡态要有一个虚频
做中国人的化学!!!!
2楼2007-12-03 22:30:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

suny2005

木虫 (小有名气)


csfn(金币+1,VIP+0):3Q,欢迎常来
即使没有虚频也不一定是全局最小,很可能是局域最小
要想得到全局最小,应该进行势能面扫描
3楼2007-12-04 08:58:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

veradpp

木虫 (正式写手)

再请教一下如何进行势能面扫描呢?
常用的软件有哪些,hyperchem 可以吗?
4楼2007-12-05 19:55:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spur

金虫 (正式写手)

Vasp、MS、Wien2K这几个软件好像都只能找到局域最小,期待高人指点什么软件可以进行势能面全扫描,找到全局最小!
5楼2007-12-05 20:49:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

deadbook

银虫 (小有名气)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,希望继续关注计算模拟版
全局最小是一个世界难题,不是哪一个商业软件随便就可以解决的。现在比较流行的比如遗传算法,还有big-bond,还有高温模拟退火等等,都是计算全局最小的方法。
6楼2007-12-05 23:41:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ggdh

专家顾问 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,希望继续关注计算模拟版
用sybyl或者macromodel里面的conformation search
7楼2007-12-13 00:00:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

呵呵 即使遗传算法也不敢说他就找到了真正的全局最小 相互作用势的复杂程度和计算时间决定他是否能找到全局最小
8楼2007-12-14 12:03:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sandf

木虫 (正式写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版解答问题。
最小都只能说是个相对的量。如果看多了那些寻找簇合物能量最小构型的文献就会知道,总是会有后面的文章说自己的研究构型能量比前人研究的小。目前用得比较多的就是基因算法。
正如7楼所说的,这是世界难题
努力呀努力,不要成为奴隶。
9楼2007-12-14 12:32:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 veradpp 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 8/400 2026-08-22 23:51 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +11 羊腰板 2026-08-21 11/550 2026-08-22 22:03 by lsbin3733
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 3/150 2026-08-22 22:03 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 zjuhero 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +3 简单化xn 2026-08-22 7/350 2026-08-22 19:46 by 简单化xn
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[教师之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 让我中一个面上吧! +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
信息提示
请填处理意见